Ex-conseiller à Matignon (France 2030) et conseiller spécial du ministre de l'enseignement supérieur et de la recherche, François Germinet a présidé l’université CY Cergy Paris Université de 2012 à 2022.
D'abord professeur de mathématiques à l'université de Cergy-Pontoise (UCP) en 2003, Il est élu élu vice-président du conseil scientifique de l’université en 2006. Il devient membre de l’IUF en 2007.
En janvier 2010, François Germinet est nommé vice-président en charge du développement stratégique et des ressources humaines de l'UCP. En 2012, il est élu président de l’université de Cergy-Pontoise, et sera réélu pour un second mandat à la présidence de l’UCP en 2016, puis en 2020 à la tête de la nouvelle université élargie : CY Cergy Paris Université.

François Germinet prend la direction du pôle connaissance du Secrétariat Général Pour l'Investissement (France 2030) en 2023, qu'il quitte pour le poste de conseiller spécial du ministre de l'enseignement supérieur et de la recherche en 2025.
En 2026, à partir de CY Ecole de Design, il lance un programme de formation et de recherche autour de la prospective d’anticipation. Et il anime « Le 106 » , un collectif non partisan, qui contribue à fonder les récits collectifs du monde qui vient, réinventer l’action publique, et faire société à partir des territoires, du vivant et du lien humain.