Pierre Wunsch ha inizialmente lavorato come assistente e ricercatore presso l’INSEE e l’École normale supérieure, poi come esperto presso l’Ufficio federale di pianificazione. Dal 2008 al 2011 è stato capo di gabinetto del ministro delle Finanze Didier Reynders.
Nel giugno 2011, Pierre Wunsch è stato nominato direttore della Banca nazionale del Belgio, di cui è diventato vice governatore nel 2015. Il 2 gennaio 2019 è succeduto a Jan Smets come governatore della Banca nazionale.