{"id":66346,"date":"2020-03-31T19:39:00","date_gmt":"2020-03-31T17:39:00","guid":{"rendered":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/?p=66346"},"modified":"2020-03-31T18:35:45","modified_gmt":"2020-03-31T16:35:45","slug":"random-testing-un-outil-cle-dans-la-gestion-de-la-crise-du-covid19","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2020\/03\/31\/random-testing-un-outil-cle-dans-la-gestion-de-la-crise-du-covid19\/","title":{"rendered":"Random Testing, un outil cl\u00e9 dans la gestion de la crise du Covid-19 ?"},"content":{"rendered":"\n

Paris. <\/em>Le recours au d\u00e9pistage est l\u2019un des sujets les plus sensibles et m\u00e9diatis\u00e9s de la crise du Coronavirus. Tester uniquement les cas graves comme c\u2019est le cas actuellement en France nous donne une vision biais\u00e9e de la s\u00e9v\u00e9rit\u00e9 de l\u2019infection, et le nombre de cas confirm\u00e9s est probablement tr\u00e8s \u00e9loign\u00e9 du nombre r\u00e9el de personnes ayant \u00e9t\u00e9 expos\u00e9es au virus. <\/p>\n\n\n\n

Les r\u00e9sultats pr\u00e9liminaires estiment des taux asymptomatiques aux alentours de 20 % sur le Diamond Princess <\/span>1<\/sup><\/a><\/span><\/span>, et jusqu\u2019\u00e0 85 % en Chine <\/span>2<\/sup><\/a><\/span><\/span>. En plus de souffrir d\u2019une grande variabilit\u00e9, ces r\u00e9sultats ne sont pas repr\u00e9sentatifs de potentielles sp\u00e9cificit\u00e9s nationales – d\u00e9mographie, comorbidit\u00e9s\u2026 – et donc difficilement extrapolables. <\/p>\n\n\n\n

Dans un article ayant beaucoup circul\u00e9 depuis sa publication le 23 mars sur l\u2019IGM Forum  <\/span>3<\/sup><\/a><\/span><\/span>, l\u2019\u00e9conomiste James Stock d\u00e9fend l\u2019urgence de la r\u00e9alisation d\u2019enqu\u00eates s\u00e9ro-\u00e9pid\u00e9miologiques par d\u00e9pistage al\u00e9atoire dans la population (\u00ab random testing<\/em> \u00bb) pour obtenir des donn\u00e9es exactes et fiables sur la pr\u00e9valence et le taux de cas asymptomatiques chez les sujets atteints du Covid-19. <\/p>\n\n\n\n

Un fort taux de cas asymptomatiques est-il une bonne nouvelle ?<\/strong><\/h4>\n\n\n\n

Intuitivement, comme soulign\u00e9 dans l’article de M. Stock, un fort taux de cas asymptomatiques est per\u00e7u de fa\u00e7on positive : on sait alors qu\u2019on est confront\u00e9s \u00e0 un virus relativement peu dangereux avec un taux de l\u00e9talit\u00e9 faible, exposant \u00e0 un moindre risque de saturation du syst\u00e8me de sant\u00e9. <\/p>\n\n\n\n

Or, les sujets ont beau \u00eatre asymptomatiques, ils sont tout de m\u00eame contagieux (d\u00e8s le d\u00e9but de la p\u00e9riode d\u2019incubation, qui peut durer 14 jours selon les estimations actuelles de l\u2019OMS). Un virus dont la majorit\u00e9 des infections sont asymptomatiques circulera rapidement et facilement dans la population, entra\u00eenant une augmentation importante du nombre de sujets ayant \u00e9t\u00e9 expos\u00e9s au virus. <\/p>\n\n\n\n

C\u2019est exactement l\u00e0 que se situe la grande difficult\u00e9 de la gestion du Covid-19. Contrairement \u00e0 des infections flamboyantes comme Ebola, il est tr\u00e8s difficile de rep\u00e9rer les cas et de les isoler. Pendant longtemps, le virus se propage \u00e0 bas bruit dans la population. Cette capacit\u00e9 d\u2019un virus \u00e0 infecter pendant la phase asymptomatique est repr\u00e9sent\u00e9e par son th\u00eata <\/em>(\u03b8). Un th\u00eata <\/em>\u00e9lev\u00e9 rend l\u2019\u00e9pid\u00e9mie particuli\u00e8rement difficile \u00e0 contenir, comme c\u2019est le cas de la grippe et du VIH – et probablement du Covid-19, bien qu\u2019\u00e0 l\u2019heure actuelle nous manquions de donn\u00e9es pour avoir une estimation fiable (cf graphe 1<\/em> <\/span>4<\/sup><\/a><\/span><\/span>). <\/p>\n\n\n\n\n\n

\n \n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \"theta\r\n <\/picture>\r\n \n
Graphe 1<\/figcaption>\n <\/a>\n<\/figure>\n\n\n

Ainsi, au moment o\u00f9 l\u2019on se rendra compte du probl\u00e8me du fait de l\u2019augmentation rapide du nombre de morts dans la population, il sera d\u00e9j\u00e0 trop tard pour suffisamment aplatir la courbe, et le syst\u00e8me de sant\u00e9 se retrouvera surcharg\u00e9 par un afflux massif de patients dans un \u00e9tat grave.<\/p>\n\n\n\n\n\n

\n \n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \"aplatir\r\n <\/picture>\r\n \n <\/a>\n<\/figure>\n\n\n

Random testing<\/em><\/strong> versus d\u00e9pistage de masse<\/strong><\/h4>\n\n\n\n

Le random testing<\/em> est une m\u00e9thode statistique pratique, informative et \u00e9conomique permettant d\u2019obtenir des donn\u00e9es fiables sur le nombre total de sujets infect\u00e9s et le taux de cas asymptomatiques au sein d\u2019une population : en testant un \u00e9chantillon repr\u00e9sentatif, il est ensuite possible d\u2019extrapoler \u00e0 la population g\u00e9n\u00e9rale sans avoir \u00e0 tester tout le monde. <\/p>\n\n\n\n

Ceci dit, il est crucial de ne pas confondre le random testing<\/em> avec le d\u00e9pistage de masse, dont la publicit\u00e9 a \u00e9t\u00e9 amplement faite dans les m\u00e9dias en France et ailleurs.<\/p>\n\n\n\n

Le d\u00e9pistage de masse, \u00e0 effectuer d\u00e8s le d\u00e9but de la crise pour une efficacit\u00e9 optimale, vise \u00e0 rapidement isoler les sujets infect\u00e9s et leurs contacts, permettant ainsi de diminuer le nombre de cas graves dans la phase aigu\u00eb. Cette technique peut s\u2019av\u00e9rer tr\u00e8s efficace, comme en attestent la r\u00e9ussite de Singapour et de Ta\u00efwan dans la r\u00e9duction du nombre de cas. Mais la fen\u00eatre d\u2019opportunit\u00e9 est tr\u00e8s \u00e9troite : pour \u00eatre efficace et rentable, le d\u00e9pistage et le tra\u00e7age des cas doivent se faire avant la circulation active du virus dans la population et la mise en place de mesures g\u00e9n\u00e9ralis\u00e9es de distanciation sociale. Force est de constater qu\u2019en France et dans la quasi-totalit\u00e9 des pays touch\u00e9s, ce stade est aujourd\u2019hui d\u00e9pass\u00e9.<\/p>\n\n\n\n

Quel est l\u2019int\u00e9r\u00eat du <\/strong>random testing<\/em><\/strong> au stade aigu de la crise ?<\/strong><\/h4>\n\n\n\n

Selon Ferguson <\/span>5<\/sup><\/a><\/span><\/span>, le succ\u00e8s des mesures de confinement d\u00e9pend de deux param\u00e8tres : le taux de reproduction R0 et le taux de cas asymptomatiques repr\u00e9sent\u00e9 par son th\u00e9ta<\/em>. Ainsi, en nous informant sur le taux de cas asymptomatiques, le random testing<\/em> est un outil important pour augmenter notre compr\u00e9hension de la dangerosit\u00e9 et de la transmission d\u2019un virus et anticiper l\u2019efficacit\u00e9 de mesures de sant\u00e9 publique. <\/p>\n\n\n\n

En m\u00eame temps, cela ne modifie pas la circulation du virus en soi et n\u2019influence donc pas directement la pression hospitali\u00e8re, surtout si r\u00e9alis\u00e9 tard dans la progression de l\u2019\u00e9pid\u00e9mie. Cela permet avant tout de corriger un biais statistique induit par l\u2019absence de d\u00e9pistage g\u00e9n\u00e9ralis\u00e9.  <\/p>\n\n\n\n

Le random testing<\/em> nous informe par ailleurs sur le nombre de sujets ayant \u00e9t\u00e9 infect\u00e9s par virus, et par extension sur l\u2019immunit\u00e9 de groupe. Ce point constitue un enjeu majeur pour les d\u00e9cideurs politiques. On consid\u00e8re qu\u2019un virus arr\u00eate sa propagation d\u00e8s lors que le R0 est inf\u00e9rieur \u00e0 1 : il devient alors impossible pour la maladie de se maintenir dans la population et elle finit par dispara\u00eetre. Le seuil d\u2019immunit\u00e9 gr\u00e9gaire \u00e0 atteindre se calcule selon la formule I=1-(1\/R0) <\/span>6<\/sup><\/a><\/span><\/span>. Avec un R0 estim\u00e9 \u00e0 2.5, on consid\u00e8re ainsi que le SARS-Cov2 interrompt sa circulation d\u00e8s lors que 60 % de la population a \u00e9t\u00e9 immunis\u00e9e. En connaissant le taux d\u2019immunisation dans la population, le d\u00e9pistage r\u00e9gulier par random testing<\/em> est donc crucial pour l\u2019adaptation des mesures de sant\u00e9 publique et la d\u00e9finition du moment optimal pour la lev\u00e9e du confinement. <\/p>\n\n\n\n

Bien \u00e9videmment, l\u2019impact de cette \u00e9pid\u00e9mie ne se restreint pas \u00e0 ses cons\u00e9quences sanitaires ; les d\u00e9g\u00e2ts sur les plans \u00e9conomique et sociaux sont incommensurables. Or, chaque jour de confinement en moins augmente les chances de survie pour le syst\u00e8me \u00e9conomique. Gr\u00e2ce \u00e0 un suivi r\u00e9gulier du taux d\u2019immunisation par random testing<\/em>, il est possible d\u2019avoir une adaptation au jour le jour des mesures de sant\u00e9 publique, et ainsi d\u2019\u00e9viter de prolonger les mesures de confinement au del\u00e0 du temps n\u00e9cessaire pour endiguer la propagation du virus. <\/p>\n\n\n\n

D\u00e8s lors, quelles pr\u00e9conisations ?<\/strong><\/h4>\n\n\n\n

A l\u2019heure actuelle, il semble fondamental de poursuivre le confinement pour permettre l\u2019installation progressive d\u2019une immunit\u00e9 collective. En \u00e9talant la survenue de cas graves dans le temps, on \u00e9vite la surcharge du syst\u00e8me de sant\u00e9, et on s\u2019approche de l\u2019arriv\u00e9e d\u2019un potentiel vaccin qui permettrait une immunisation collective acquise efficace. <\/p>\n\n\n\n

Mais en parall\u00e8le, il serait n\u00e9cessaire de mettre en place une strat\u00e9gie de random testing<\/em> afin d\u2019\u00eatre \u00e9clair\u00e9s sur le taux d\u2019immunisation dans la population, indicateur fondamental pour adapter les mesures de confinement et limiter un effondrement \u00e9conomique. Se pose toutefois la question de l\u2019\u00e9chelle pertinente<\/em> – \u00e9tant donn\u00e9es les diff\u00e9rences de circulation virale entre r\u00e9gions, l\u2019\u00e9chelle nationale n\u2019est peut-\u00eatre pas la plus adapt\u00e9e. <\/span>7<\/sup><\/a><\/span><\/span> <\/p>\n\n\n\n

On pourrait ainsi imaginer une strat\u00e9gie de \u00ab suivi participatif de l\u2019immunit\u00e9 \u00bb, avec une communication politique bas\u00e9e sur ces taux d\u2019immunisation : au lieu de laisser la population dans le flou par rapport au moment de lev\u00e9e d\u00e9finitive du confinement, on leur donne une indication de l\u2019\u00e9volutivit\u00e9 de la situation. L\u2019adh\u00e9sion aux mesures de confinement peut \u00eatre renforc\u00e9 par la connaissance du chemin restant avant d\u2019atteindre le seuil d\u2019immunisation n\u00e9cessaire \u00e0 sa lev\u00e9e d\u00e9finitive. L\u2019\u00e9volutivit\u00e9 de la situation devient alors palpable, et permet par ce biais, peut-\u00eatre, de surmonter la diminution progressive de motivation inh\u00e9rente \u00e0 tout confinement prolong\u00e9. Cette strat\u00e9gie peut s\u2019av\u00e9rer particuli\u00e8rement utile pour \u00e9viter la survenue d\u2019un rebond lors de la phase de d\u00e9croissance de l\u2019\u00e9pid\u00e9mie, en association avec une lev\u00e9e progressive du confinement.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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