{"id":144508,"date":"2022-06-16T15:42:47","date_gmt":"2022-06-16T13:42:47","guid":{"rendered":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/?p=144508"},"modified":"2022-06-16T15:42:57","modified_gmt":"2022-06-16T13:42:57","slug":"une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/","title":{"rendered":"Une nouvelle \u00e9pid\u00e9mie&#160;? 10 points sur la variole du singe"},"content":{"rendered":"\n<div class=\"wp-block-lgc-keypoints key-block\"><div class=\"keys\"><h6 class=\"font-fold text-sm uppercase\">Key Points<\/h6>\n<ul class=\"wp-block-list\"><li>\u00c0 ce stade, on consid\u00e8re que l\u2019on peut classer l\u2019ensemble des souches virales de monkeypox responsables d\u2019\u00e9pid\u00e9mies de variole du singe en deux \u00ab&#160;clades&#160;\u00bb soit deux familles, le clade du \u00ab&#160;Bassin Congo&#160;\u00bb et le clade \u00ab&#160;Ouest Africain&#160;\u00bb.<\/li><li>L\u2019incubation peut durer de 4 \u00e0 20 jours, la fi\u00e8vre dure en g\u00e9n\u00e9ral quelques jours, et la maladie gu\u00e9rit, le plus souvent spontan\u00e9ment, g\u00e9n\u00e9ralement en 2 \u00e0 4 semaines.<\/li><li>L\u2019\u00e9pid\u00e9mie de 2022 pr\u00e9sente un nombre croissant de cas sans aucun lien direct, ni avec un pays d\u2019Afrique, ni avec un animal contamin\u00e9. Or si l\u2019on avait d\u00e9j\u00e0 observ\u00e9 des transmissions interhumaines communautaires du <em>monkeypox virus<\/em>, cela n\u2019a jamais \u00e9t\u00e9 le cas hors d\u2019Afrique.<\/li><li>Pour endiguer l&rsquo;\u00e9pid\u00e9mie, une premi\u00e8re solution pourrait \u00eatre la <em>ring vaccination<\/em> ou vaccination cibl\u00e9e. Un protocole \u00e9prouv\u00e9 visant \u00e0 cr\u00e9er \u00ab&#160;un anneau vaccinal autour d\u2019un cas&#160;\u00bb afin d\u2019emp\u00eacher la diffusion tout en pr\u00e9servant des moyens logistiques et sanitaires s\u00e9rieusement mis sous pression par des campagnes de vaccination de masse.<\/li><\/ul>\n<\/div><\/div>\n\n\n\n<h2 class=\"wp-block-heading\">1 \u2014\u00a0<strong>\u00c0 tout instant, beaucoup de virus et de bact\u00e9ries circulent. <\/strong>Quand<strong> doit-on s\u2019y int\u00e9resser et \u00e9ventuellement prendre des mesures particuli\u00e8res&#160;?<\/strong><\/h2>\n\n\n\n<p>Les virus sont des entit\u00e9s parasitiques intracellulaires obligatoires, ils sont en quelque sorte \u00ab&#160;condamn\u00e9s&#160;\u00bb \u00e0 l\u2019air libre, et \u00e0 passer d\u2019h\u00f4te en h\u00f4te pour se reproduire en permanence, sans quoi ils disparaissent.<\/p>\n\n\n\n<p>Le monde des virus est donc un monde condamn\u00e9 \u00e0 la croissance permanente. Pas de quoi paniquer pour autant, car l\u2019immense majorit\u00e9 des virus n\u2019est pas pathog\u00e8ne pour l\u2019homme, et m\u00eame au sein de ceux qui sont pathog\u00e8nes, l\u2019immense majorit\u00e9 des nouveaux virus produits sera d\u00e9truite par des syst\u00e8mes immunitaires ou par l\u2019environnement.<\/p>\n\n\n\n<p>Ainsi, le SARS-COV-2 peut survivre plusieurs heures sur certaines surfaces, ce qui est \u00e0 la fois pr\u00e9occupant \u2013&nbsp;car cela requiert une d\u00e9sinfection r\u00e9guli\u00e8re de ces derni\u00e8res \u2013 mais contient un aspect rassurant en creux&#160;: l\u2019environnement ext\u00e9rieur est un lieu hostile pour les virus qui finissent par y \u00eatre d\u00e9truits au bout d\u2019un certain temps. L\u2019environnement contient donc, \u00e0 chaque instant, un nombre extr\u00eamement important de virus. On peut d\u2019ailleurs dater la naissance de la microbiologie au sens large au XVII<sup>e<\/sup> si\u00e8cle, lorsque le tapissier n\u00e9erlandais Antoine van Leeuwenhoek invente les premi\u00e8res lentilles de microscope, et, observant l\u2019int\u00e9rieur des cavit\u00e9s buccales avec d\u00e9clare que \u00ab&#160;la bouche d\u2019un seul homme contient plus de ces animalcules que tout le royaume ne contient d\u2019habitants&#160;\u00bb. Sachant que les virus sont encore plus pr\u00e9valents que les bact\u00e9ries, on peut imaginer le choc qu\u2019il aurait ressenti s\u2019il avait pu observer des virus, trop petits pour \u00eatre observables avec des microscopes optiques.&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>La question des bact\u00e9ries est bien plus complexe que celle des virus. D\u00e9j\u00e0 parce qu\u2019il s\u2019agit d\u2019entit\u00e9s bien plus grosses que ne le sont les virus, et surtout parce que nos relations avec elles sont beaucoup plus riches, complexes et nuanc\u00e9es. De mani\u00e8re g\u00e9n\u00e9rale les virus sont soit pathog\u00e8nes, pour l\u2019homme, des v\u00e9g\u00e9taux ou des animaux, auquel cas ils ont un potentiel de nuisance pour l\u2019esp\u00e8ce humaine plus ou moins important, soit non pathog\u00e8nes, auquel cas ils sont globalement neutres. Un rare exemple \u00ab&#160;d\u2019apport&#160;\u00bb suppos\u00e9 des virus \u00e0 l\u2019humanit\u00e9 consiste en la syncitine, une prot\u00e9ine humaine jouant un r\u00f4le clef dans la placentation, et qui nous aurait \u00e9t\u00e9 apport\u00e9e par les virus. En dehors de cela, les virus sont l\u2019immense majorit\u00e9 du temps soit n\u00e9fastes pour l\u2019humanit\u00e9, soit neutres.<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-pullquote\"><blockquote><p>Si le monde est perp\u00e9tuellement rempli d\u2019un oc\u00e9an infini de virus et de micro-organismes, pourquoi se pr\u00e9occuper soudainement d\u2019un virus ou d\u2019une bact\u00e9rie en particulier, qu\u2019il s\u2019agisse du Sars-Cov-2, d\u2019une nouvelle souche du <em>monkeypox<\/em>, de la grippe, ou de la bact\u00e9rie E. Coli&#160;? L\u2019\u00e9l\u00e9ment clef dans tout \u00e9v\u00e9nement li\u00e9 \u00e0 un micro-organisme pathog\u00e8ne est la nouveaut\u00e9.<\/p><cite>Xavier Olessa-Daragon<\/cite><\/blockquote><\/figure>\n\n\n\n<p>Les bact\u00e9ries quant \u00e0 elles, sont tout autant voire m\u00eame plus souvent b\u00e9n\u00e9fiques \u00e0 l\u2019esp\u00e8ce humaine qu\u2019elles ne sont pathog\u00e8nes. Elles jouent entre beaucoup d\u2019autres un r\u00f4le clef dans le d\u00e9veloppement des \u00e9cosyst\u00e8mes, mais aussi de nos syst\u00e8mes digestifs et immunitaires. Souvent la m\u00eame bact\u00e9rie peut m\u00eame \u00eatre neutre, b\u00e9n\u00e9fique ou pathog\u00e8ne en fonction des circonstances. Nos relations avec les bact\u00e9ries, mais aussi les relations qu\u2019entretiennent les bact\u00e9ries entre elles, ainsi qu\u2019avec les autres microorganismes \u2013&nbsp;n\u2019oublions pas que la p\u00e9nicilline comme nombre d\u2019autres antibiotiques sont des armes chimiques d\u00e9velopp\u00e9es par les <em>fungi<\/em> contre les bact\u00e9ries \u2013 constituent ainsi une sorte de \u00ab&#160;g\u00e9opolitique microscopique&#160;\u00bb extr\u00eamement complexe. Enfin, il existe un dernier acteur clef dans ces dynamiques, \u00e0 savoir les virus infectant les bact\u00e9ries. Appel\u00e9s bact\u00e9riophages, souvent abr\u00e9g\u00e9s en \u00ab&#160;phages&#160;\u00bb ils sont pr\u00e9sents sur Terre en un nombre \u00e0 proprement parler incalculable. Constituant une des perspectives th\u00e9rapeutique et prophylactique les plus enthousiasmantes dans un monde post antibiotiques, ils constituent \u00e9galement un \u00e9l\u00e9ment absolument essentiel de r\u00e9gulation de la population bact\u00e9rienne mondiale. On a m\u00eame coutume de dire pour forcer le trait que si les bact\u00e9riophages disparaissaient du jour au lendemain, les bact\u00e9ries recouvriraient toute la surface terrestre en un peu plus de 24 heures.<\/p>\n\n\n\n<p>Mais si le monde est perp\u00e9tuellement rempli d\u2019un oc\u00e9an infini de virus et de micro-organismes, pourquoi se pr\u00e9occuper soudainement d\u2019un virus ou d\u2019une bact\u00e9rie en particulier, qu\u2019il s\u2019agisse du Sars-Cov-2, d\u2019une nouvelle souche du <em>monkeypox<\/em>, de la grippe, ou de la bact\u00e9rie E. Coli&#160;? L\u2019\u00e9l\u00e9ment clef dans tout \u00e9v\u00e9nement li\u00e9 \u00e0 un micro-organisme pathog\u00e8ne est la nouveaut\u00e9.<\/p>\n\n\n\n<p>Historiquement, il a tout d\u2019abord \u00e9t\u00e9 question de capacit\u00e9 nouvelle \u00e0 d\u00e9tecter la pr\u00e9sence des micro-organismes, puis du lien entre des micro-organismes et des maladies. La tuberculose pulmonaire et les personnes dites \u00ab&#160;bossues&#160;\u00bb existent depuis l\u2019Antiquit\u00e9. Mais ce n\u2019est qu\u2019\u00e0 la fin du XIX<sup>e<\/sup> si\u00e8cle, que Robert Koch, futur Prix Nobel de m\u00e9decine 1905, va permettre de faire le lien entre ces pathologies et un micro-organisme, <em>Mycobacterium Tuberculosis<\/em>, qui en est la cause. La polio existe elle aussi depuis l\u2019antiquit\u00e9, en t\u00e9moigne entre autres des repr\u00e9sentations de personnes estropi\u00e9es sur des st\u00e8les \u00e9gyptiennes. Mais ce n\u2019est qu\u2019au XX<sup>e<\/sup> si\u00e8cle qu\u2019on fera le lien entre cette maladie et le poliovirus. La nouveaut\u00e9 des moyens techniques et du savoir scientifique va donc entra\u00eener un int\u00e9r\u00eat aigu pour <em>Mycobacterium Tuberculosis<\/em> et le poliovirus, qui circulent pourtant au sein de l\u2019humanit\u00e9 depuis des mill\u00e9naires. Un d\u00e9but de r\u00e9ponse anachronique \u00e0 ce paradoxe pourrait mettre en avant les cons\u00e9quences qu\u2019on eut cet \u00ab&#160;emballement&#160;\u00bb. Cet int\u00e9r\u00eat et cette prise de conscience de l\u2019ensemble des d\u00e9g\u00e2ts inflig\u00e9s \u00e0 l\u2019humanit\u00e9 par ces microorganismes va entra\u00eener une r\u00e9action, et notamment le d\u00e9veloppement d\u2019antibiotiques et surtout de vaccins qui vont permettre de faire reculer de fa\u00e7on extr\u00eamement significative leur circulation au sein des pays industrialis\u00e9s. Des maladies qui ravageaient l\u2019humanit\u00e9 depuis des si\u00e8cles, voire des mill\u00e9naires, ont pu voir leurs ravages tr\u00e8s s\u00e9rieusement r\u00e9duits par la nouveaut\u00e9 des moyens dont on disposait.&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>Un autre cas de figure concerne <em>des souches nouvelles<\/em>, qui le plus souvent vont se retrouver dans <em>des endroits nouveaux<\/em>.&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p><em>Des souches nouvelles<\/em> avec des propri\u00e9t\u00e9s les rendant potentiellement plus pathog\u00e8nes et ou plus transmissibles \u00e0 l\u2019\u00eatre humain et entre \u00eatres humains. Non pas pathog\u00e8nes ou transmissibles, mais <em>plus<\/em> pathog\u00e8nes et ou <em>plus<\/em> transmissibles. C\u2019est un \u00e9l\u00e9ment essentiel.&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p><em>Des endroits nouveaux<\/em>&#160;: c\u2019est l\u00e0 un autre \u00e9l\u00e9ment tout aussi essentiel. Pour qu\u2019un danger devienne un risque, il faut que les populations vuln\u00e9rables soient expos\u00e9es \u00e0 ce danger. Une souche d\u2019\u00c9bola enferm\u00e9e dans le laboratoire \u00e0 ultra haute s\u00e9curit\u00e9 P4 de Lyon pr\u00e9sente un risque extr\u00eamement faible. En revanche, une souche d\u2019E.Coli pathog\u00e8ne pr\u00e9sente au c\u0153ur m\u00eame d\u2019une usine d\u2019agroalimentaire et qui va se retrouver dans des plats cuisin\u00e9s comme les pizzas pr\u00e9sente un risque tr\u00e8s \u00e9lev\u00e9. La m\u00eame souche pr\u00e9sente \u00e0 quelques centaines de m\u00e8tres, en dehors de l\u2019usine, en consid\u00e9rant que l\u2019usine dispose de mesures d\u2019hygi\u00e8ne appropri\u00e9es, pr\u00e9senterait un risque bien plus faible. De la m\u00eame mani\u00e8re, un pathog\u00e8ne pr\u00e9sent dans la ventilation d\u2019un a\u00e9roport international pr\u00e9sente un risque infiniment plus \u00e9lev\u00e9 que le m\u00eame pathog\u00e8ne pr\u00e9sent dans un \u00e9tang isol\u00e9 au c\u0153ur d\u2019une for\u00eat tr\u00e8s enclav\u00e9e. L\u2019\u00e9mergence de nouveaux pathog\u00e8nes se fait souvent par l\u2019arriv\u00e9e de ce pathog\u00e8ne dans un endroit nouveau. Cela se fait aussi souvent en m\u00eame temps que l\u2019arriv\u00e9e d\u2019un pathog\u00e8ne infectant d\u2019abord animal au sein d\u2019un h\u00f4te nouveau \u00e0 savoir l\u2019\u00eatre humain. Cela peut \u00eatre dus \u00e0 divers ph\u00e9nom\u00e8nes, et on peut craindre que les destructions en cha\u00eene d\u2019\u00e9cosyst\u00e8mes et d\u2019habitats naturels de nombreux organismes n\u2019entra\u00eene une recrudescence de nouveaux pathog\u00e8nes arrivant dans des endroits nouveaux ou ils seront susceptibles de nuire \u2013\u00a0la grande revanche de la g\u00e9ographie.<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-pullquote\"><blockquote><p>Un pathog\u00e8ne pr\u00e9sent dans la ventilation d\u2019un a\u00e9roport international pr\u00e9sente un risque infiniment plus \u00e9lev\u00e9 que le m\u00eame pathog\u00e8ne pr\u00e9sent dans un \u00e9tang isol\u00e9 au c\u0153ur d\u2019une for\u00eat tr\u00e8s enclav\u00e9e. L\u2019\u00e9mergence de nouveaux pathog\u00e8nes se fait souvent par l\u2019arriv\u00e9e de ce pathog\u00e8ne dans un endroit nouveau.<\/p><cite>Xavier Olessa-Daragon<\/cite><\/blockquote><\/figure>\n\n\n\n<p>Qu\u2019entend-on par des souches \u00ab&#160;plus&#160;\u00bb pathog\u00e8nes ou transmissibles&#160;? Dans l\u2019immense majorit\u00e9 des cas, les nouveaux pathog\u00e8nes sont de nouvelles souches de pathog\u00e8nes eux-m\u00eames d\u00e9j\u00e0 connus. Il existe des cas o\u00f9 une esp\u00e8ce relativement \u00e9loign\u00e9e des esp\u00e8ces connues les plus proches \u00e9merge. Si l\u2019on prend <a href=\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/observatoire-coronavirus\/\">l\u2019exemple du Sars-Cov-2<\/a>, on connaissait d\u00e9j\u00e0 les coronavirus, et il est relativement proche du virus du SRAS, le Sars-Cov-1, responsable d\u2019une \u00e9pid\u00e9mie en 2003. Cela vaut aussi pour la grippe, comme pour la variole du singe. Il s\u2019agit ainsi rarement de virus enti\u00e8rement nouveaux, mais de \u00ab&#160;nouvelles versions&#160;\u00bb&#160;: on a affaire \u00e0 des ph\u00e9nom\u00e8nes se rapprochant de <a href=\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2021\/12\/29\/la-pandemie-infinie-10-points-sur-omicron-le-vaccin-et-les-scenarios-contre-le-covid-19\/\">l\u2019\u00e9mergence des variants<\/a>, mais \u00e0 une \u00e9chelle plus importante. Pourquoi la question de la nouveaut\u00e9 est alors si importante&#160;? De nombreux micro-organismes tr\u00e8s pathog\u00e8nes ont le potentiel d\u2019infliger des d\u00e9g\u00e2ts consid\u00e9rables \u00e0 l\u2019humanit\u00e9. La plupart sont connus et \u00e9tudi\u00e9s et presque aucun ne circule \u00e0 grande \u00e9chelle sans que l\u2019on ne travaille activement sur des pistes th\u00e9rapeutiques et prophylactiques. On dispose souvent au moins d\u2019un minimum de perspectives th\u00e9rapeutiques. Malaria, fi\u00e8vre jaune, dengue, et tuberculoses r\u00e9sistantes aux antibiotiques sont des maladies dues \u00e0 des agents infectieux qui tuent \u00e9norm\u00e9ment d\u2019\u00eatres humains chaque ann\u00e9e, et ce sur de larges zones g\u00e9ographiques. Mais aucun d\u2019entre eux ne constitue \u00ab&#160;un sujet&#160;\u00bb du d\u00e9bat public. La nature des zones et des populations touch\u00e9es participe probablement beaucoup \u00e0 cela, \u00e0 la fois par la perception que de meilleures conditions d\u2019hygi\u00e8ne r\u00e9duiraient fortement la pr\u00e9valence de ces maladies, et parce que certains morts \u00e9meuvent moins que d\u2019autres.\u00a0<\/p>\n\n\n\n<p>On peut cependant noter que le VIH, avec une pr\u00e9valence consid\u00e9rablement r\u00e9duite mais toujours loin d\u2019\u00eatre nulle en Occident, ne semble plus \u00eatre un sujet si pr\u00e9occupant dans le d\u00e9bat public. Le virus circule toujours en Occident, mais on le conna\u00eet, on l\u2019a \u00e9tudi\u00e9, et on dispose maintenant de traitements extr\u00eamement efficaces. \u00c0 l\u2019inverse, une des derni\u00e8res \u00e9pid\u00e9mies d\u2019Ebola (2014-2016) a eu beau se d\u00e9clarer en Afrique centrale dans des zones tr\u00e8s peu industrialis\u00e9es et provoquer in fine moins de 20 cas et un seul mort en dehors d\u2019Afrique , le monde entier s\u2019en est imm\u00e9diatement pr\u00e9occup\u00e9 et \u00ab&#160;The Ebola Fighters&#160;\u00bb ont \u00e9t\u00e9 nomm\u00e9s <em>2014 Time Magazine Person of the year<\/em>. Parce que le virus est extr\u00eamement mortel et que l\u2019on ne dispose pas de traitements, mais aussi parce que la souche \u00e9tait nouvelle. Si, demain, la m\u00eame souche d\u2019\u00c9bola r\u00e9appara\u00eet au m\u00eame endroit, cela fera toujours parler en raison du taux de mortalit\u00e9 et des sympt\u00f4mes tr\u00e8s spectaculaires de ce virus, mais les autorit\u00e9s se montreront probablement bien plus rassurantes et seront probablement bien plus s\u00fbres d\u2019elles que pour \u00e9voquer une nouvelle souche de variole du singe pourtant bien moins mortelle. Tout simplement parce qu\u2019il y en a une que l\u2019on conna\u00eet, et l\u2019autre que l\u2019on ne conna\u00eet pas et qui renferme donc un champ de dangers potentiels bien plus vaste. On sait ce que fait la souche d\u2019\u00c9bola de 2016, mais on sait \u00e9galement ce que, jusqu\u2019\u00e0 maintenant en tout cas, elle ne fait pas. Elle ne cause pas de pand\u00e9mie car elle tue si vite que ses h\u00f4tes n\u2019ont pas le temps de beaucoup la transmettre, ce qui entra\u00eene un R0 faible, et fait que les \u00e9pid\u00e9mies n\u2019\u00e9voluent jusqu\u2019\u00e0 maintenant pas en pand\u00e9mie. Beaucoup de morts, donc, mais un foyer qui reste tr\u00e8s restreint g\u00e9ographiquement. Mais qui peut pr\u00e9dire ce que fera une souche nouvelle&#160;? Depuis la d\u00e9couverte du variant Omicron du Sars-Cov-2 fin d\u00e9cembre 2021, aucun nouveau variant n\u2019a \u00e9merg\u00e9 et n\u2019est devenu majoritaire.<\/p>\n\n\n\n<p>On est pass\u00e9 d\u2019une sous-famille de variant BA-2 \u00e0 BA-5 et il existe de nombreux et passionnants d\u00e9bats sur le degr\u00e9 de diff\u00e9rence g\u00e9n\u00e9tique \u00e0 partir duquel on passe d\u2019une sous famille \u00e0 une famille, et ou se situe la fronti\u00e8re avec ce que l\u2019on qualifie de \u201cnouveau\u201d variant mais en simplifiant \u00e9norm\u00e9ment on peut consid\u00e9rer qu\u2019on \u00e0 depuis Omicron pas vu \u00e9merger de souche du virus poss\u00e9dant des propri\u00e9t\u00e9s \u00ab&#160;significativement&#160;\u00bb diff\u00e9rentes. Ainsi, quand bien m\u00eame on a assist\u00e9 \u00e0 plusieurs remont\u00e9es des courbes de contaminations et eu des dizaines de milliers de morts en Europe, cela a suscit\u00e9 bien moins de craintes que lors de l\u2019\u00e9mergence des variants \u00ab&#160;significativement diff\u00e9rents&#160;\u00bb comme celui, dit \u00ab&#160;anglais&#160;\u00bb, puis Delta et Omicron. Parce qu\u2019on ignore les propri\u00e9t\u00e9s d\u2019un nouveau variant, ce sont toutes ces propri\u00e9t\u00e9s potentielles qui font peur, plus que des propri\u00e9t\u00e9s av\u00e9r\u00e9es et connues, m\u00eame tr\u00e8s dangereuses. \u00ab&#160;Mieux vaut le diable qu\u2019on conna\u00eet que celui qu\u2019on ignore.&#160;\u00bb<\/p>\n\n\n\n<p>La Haute Autorit\u00e9 de Sant\u00e9 fran\u00e7aise indiquait d\u2019ailleurs dans son communiqu\u00e9 de presse du 24 mai 2022 que&#160;:<\/p>\n\n\n\n<p>\u00ab&#160;La HAS adaptera cette recommandation pr\u00e9liminaire en fonction des nouvelles donn\u00e9es \u00e9pid\u00e9miologiques et cliniques disponibles et souligne l\u2019importance de disposer prochainement de&#160;:<\/p>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\"><li>Donn\u00e9es plus pr\u00e9cises sur le mode transmission interhumaine pour les cas actuellement identifi\u00e9s&#160;;<\/li><li>Donn\u00e9es de suivi de l\u2019\u00e9pid\u00e9mie&#160;;<\/li><li>Donn\u00e9es en vie r\u00e9elle compl\u00e9mentaires relatives \u00e0 l\u2019efficacit\u00e9 et \u00e0 la tol\u00e9rance du vaccin antivariolique de 3<sup>e<\/sup> g\u00e9n\u00e9ration, administr\u00e9 en pr\u00e9 exposition et en post exposition au virus du <em>Monkeypox<\/em>, sur la pr\u00e9vention des formes graves et sur la transmission de la maladie&#160;;<\/li><li>Donn\u00e9es relatives \u00e0 l\u2019efficacit\u00e9 et \u00e0 la tol\u00e9rance d\u2019une dose de rappel chez les personnes qui ont \u00e9t\u00e9 vaccin\u00e9es contre la variole dans leur enfance&#160;\u00bb<\/li><\/ul>\n\n\n\n<p>Les situations, de la fin 2021 au printemps 2022, du variant omicron \u00e0 la variole du singe en passant par la grippe, sont un m\u00e9lange des deux cadres de nouveaut\u00e9 pr\u00e9sent\u00e9s. On a affaire \u00e0 des souches nouvelles, mais on dispose \u00e9galement de moyens nouveaux.<\/p>\n\n\n\n<p>Les capacit\u00e9s de s\u00e9quen\u00e7age du g\u00e9nome permettent d\u00e9sormais de d\u00e9tecter tr\u00e8s rapidement l\u2019apparition d\u2019une nouvelle souche et de la transmettre aux laboratoires du monde entier pour leur permettre de la d\u00e9tecter eux aussi. Or on ne trouve que ce que l\u2019on cherche, c\u2019est-\u00e0-dire ce que l\u2019on veut chercher et ce que l\u2019on peut chercher. La pand\u00e9mie de Covid-19 a renforc\u00e9 tr\u00e8s significativement les deux&#160;: les moyens de s\u00e9quen\u00e7age ont \u00e9t\u00e9 d\u00e9cupl\u00e9s, et le rythme avec lequel on s\u00e9quence l\u2019a \u00e9t\u00e9 tout autant.<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-pullquote\"><blockquote><p>Or on ne trouve que ce que l\u2019on cherche, c\u2019est-\u00e0-dire ce que l\u2019on veut chercher et ce que l\u2019on peut chercher. La pand\u00e9mie de Covid-19 a renforc\u00e9 tr\u00e8s significativement les deux&#160;: les moyens de s\u00e9quen\u00e7age ont \u00e9t\u00e9 d\u00e9cupl\u00e9s, et le rythme avec lequel on s\u00e9quence l\u2019a \u00e9t\u00e9 tout autant.\u00a0<\/p><cite>Xavier Olessa-Daragon<\/cite><\/blockquote><\/figure>\n\n\n\n<p>\u00c0 ce titre on peut noter, en simplifiant beaucoup, une des diff\u00e9rences pratiques majeures entre d\u2019un c\u00f4t\u00e9 la RT-qPCR et les tests antig\u00e9niques et de l\u2019autre le s\u00e9quen\u00e7age. La PCR cherche une s\u00e9quence g\u00e9nomique bien pr\u00e9cise, et r\u00e9pond de fa\u00e7on binaire sur la pr\u00e9sence ou l\u2019absence de cette s\u00e9quence. Les tests antig\u00e9niques font de m\u00eame avec une r\u00e9ponse binaire sur la pr\u00e9sence ou l\u2019absence de motifs antig\u00e9niques pr\u00e9cis appartenant \u00e0 un virus pr\u00e9cis. Le s\u00e9quen\u00e7age, lui, donne une r\u00e9ponse bien plus vaste en fournissant la s\u00e9quence g\u00e9nomique de tout ou presque ce qui se trouvait dans l\u2019\u00e9chantillon donn\u00e9 \u00e0 s\u00e9quencer. Ainsi, en s\u00e9quen\u00e7ant pour \u00e9tudier l\u2019\u00e9volution du g\u00e9nome des souches de Sars Cov 2, (pr\u00e9cis\u00e9ment le type d\u2019op\u00e9ration de s\u00e9quen\u00e7age de \u00ab&#160;routine \u00e9pid\u00e9miologique&#160;\u00bb qui a permis aux \u00e9quipes m\u00e9dicales d\u2019Afrique du Sud de d\u00e9tecter et d\u2019alerter tr\u00e8s pr\u00e9cocement sur l\u2019\u00e9mergence du variant Omicron) on a pu tomber par s\u00e9rendipit\u00e9 sur une nouvelle souche de variole du singe ou de grippe. Cela pourrait en partie expliquer pourquoi on a d\u00e9tect\u00e9 aussi vite autant de cas de variole du singe dans autant de pays.<\/p>\n\n\n\n<h2 class=\"wp-block-heading\">2 \u2014 <strong>Qu\u2019est-ce que la variole du singe&#160;?<\/strong><\/h2>\n\n\n\n<p>Il s\u2019agit d\u2019une maladie caus\u00e9e par le <em>Monkeypox virus<\/em>, un virus \u00e0 ADN double brin du genre Orthopoxvirus de la famille des Poxviridae&nbsp;<span class='whitespace-nowrap'><span id='easy-footnote-1-144508' class='easy-footnote-margin-adjust'><\/span><span class='easy-footnote'><a href='https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/#easy-footnote-bottom-1-144508' title='Guillaume Croville, Mathilda Walch, Jean-Luc Gu\u00e9rin, Jean-Michel Mansuy, Christophe Pasquier\u00a0 \u201c&lt;a href=&quot;https:\/\/virological.org\/t\/first-french-draft-genome-sequence-of-monkeypox-virus-may-2022\/819&quot; target=&quot;_blank&quot; rel=&quot;noreferrer noopener&quot;&gt;https:\/\/virological.org\/t\/first-french-draft-genome-sequence-of-monkeypox-virus-may-2022\/819&lt;\/a&gt;\u201d, &lt;em&gt;Virological, &lt;\/em&gt;26 mai 2022.'><sup>1<\/sup><\/a><\/span><\/span>.<\/p>\n\n\n\n<p>Le genre orthopoxvirus comprend \u00e9galement le virus de la variole, mais le <em>Monkeypox virus<\/em> ne descendrait pas directement de celui-ci.<\/p>\n\n\n\n<p>Son nom vient de la d\u00e9couverte du virus chez des macaques de laboratoire dans un laboratoire danois en 1958. Le premier cas humain a \u00e9t\u00e9 identifi\u00e9 en R\u00e9publique D\u00e9mocratique du Congo en 1970. On peut \u00e0 ce titre faire une parenth\u00e8se concernant la nomenclature li\u00e9e au virus. Jusqu\u2019\u00e0 l\u2019heure de l\u2019\u00e9criture de ces lignes, les diff\u00e9rents clades du virus sont d\u00e9nomm\u00e9s apr\u00e8s des r\u00e9gions g\u00e9ographiques africaines, et elles seront mentionn\u00e9es telles quelles. Cependant cela est susceptible de changer \u00e9tant donn\u00e9 l\u2019appel r\u00e9cent d\u2019un grand nombre de scientifique a changer cette nomenclature afin d\u2019en retirer le c\u00f4t\u00e9 stigmatisant et discutable car liant encore \u00e0 des zones d\u2019Afrique un virus qui se transmet maintenant en dehors d\u2019Afrique&nbsp;<span class='whitespace-nowrap'><span id='easy-footnote-2-144508' class='easy-footnote-margin-adjust'><\/span><span class='easy-footnote'><a href='https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/#easy-footnote-bottom-2-144508' title='&lt;a href=&quot;https:\/\/virological.org\/t\/urgent-need-for-a-non-discriminatory-and-non-stigmatizing-nomenclature-for-monkeypox-virus\/853&quot; target=&quot;_blank&quot; rel=&quot;noreferrer noopener&quot;&gt;Urgent need for a non-discriminatory and non-stigmatizing nomenclature for monkeypox virus &amp;#8211; Monkeypox &amp;#8211; Virological&lt;\/a&gt;'><sup>2<\/sup><\/a><\/span><\/span>. Appel entendu par l\u2019OMS qui travaille d\u00e9sormais sur une nouvelle nomenclature. On peut faire le parall\u00e8le avec le variant omicron, issu l\u00e0 encore d\u2019une volont\u00e9 de casser la dynamique de d\u00e9nomination g\u00e9ographique (variant anglais, variant br\u00e9silien\u2026 omicron serait ainsi probablement devenu le variant sud-africain) stigmatisante. En mati\u00e8re m\u00e9dicale, l\u2019association entre nomenclature et g\u00e9ographie m\u00e8ne malheureusement trop souvent \u00e0 la stigmatisation et c\u2019est maintenant un enjeu bien compris et pris en compte.\u00a0<\/p>\n\n\n\n<p>Se pose enfin la question m\u00eame du terme \u00ab&#160;variole du singe&#160;\u00bb, et de son caract\u00e8re potentiellement source de beaucoup de confusion \u00e9tant donn\u00e9 que m\u00eame s\u2019il constitue un h\u00f4te potentiel le virus semble circuler tr\u00e8s peu voir pas chez les signes qui ne semblent ainsi pas li\u00e9s du tout aux \u00e9pid\u00e9mies de \u00ab&#160;variole du singe&#160;\u00bb. Parler de \u00ab&#160;variole du singe&#160;\u00bb pour une maladie sans lien avec le singe est ainsi potentiellement source de confusion et quelque peu contre productif\u2026 Cependant le fondement du langage et de la nomenclature est d\u2019employer les m\u00eames mots pour parler de la m\u00eame chose\u2026 Un des enjeux majeurs de la construction et de l\u2019organisation des sciences a \u00e9t\u00e9 pr\u00e9cis\u00e9ment l\u2019\u00e9tablissement de nomenclatures communes pour que des scientifiques du monde entier puissent ais\u00e9ment se comprendre et que la m\u00eame mol\u00e9cule ou le m\u00eame virus aient le m\u00eame nom partout sur Terre. Malgr\u00e9 cela on a encore en g\u00e9n\u00e9tique trop d\u2019exemples de g\u00e8nes poss\u00e9dant plusieurs noms car ceux qui ont d\u00e9cid\u00e9 de s\u2019y int\u00e9resser les ont nomm\u00e9s sans avoir\u00a0 (ou parfois sans faire l\u2019effort de prendre) connaissance d\u2019une autre d\u00e9nomination d\u00e9j\u00e0 \u00e9tablie par d\u2019autres pour parler de la m\u00eame chose. La nomenclature de chimie organique peut sembler incroyablement fastidieuse, rigide et parfois saugrenue \u00e0 quiconque tente de s\u2019y familiariser\u2026 mais elle permet en th\u00e9orie \u00e0 n\u2019importe qui de dessiner avec pr\u00e9cision n\u2019importe quelle mol\u00e9cule organique avec pour seule information son nom\u2026 b\u00e9n\u00e9fice non n\u00e9gligeable. <\/p>\n\n\n\n<p>Or les discussions actuelles sur un changement de nom de la \u2013\u00a0pour le moment encore\u00a0\u2013 \u00ab&#160;variole du singe&#160;\u00bb semblent porter sur un nomenclature des clades dor\u00e9navant sans mention de zones g\u00e9ographiques africaines et sur la d\u00e9stigmatisation mais conserver le terme anglais <em>monkeypox<\/em>, jusqu\u2019ici traduit en fran\u00e7ais par \u00ab&#160;variole du singe&#160;\u00bb. Ainsi quand bien m\u00eame on peut l\u00e9gitimement s\u2019interroger sur ce nom, en attente de d\u00e9cision collective visant \u00e0 en changer en \u00e9tant d\u2019accord sur le terme \u00e0 utiliser \u00e0 la place, il semble que la balance b\u00e9n\u00e9fice risque en termes de clart\u00e9 penche en faveur de la poursuite de l\u2019emploi de ce terme.\u00a0<\/p>\n\n\n\n<p>La maladie d\u00e9bute g\u00e9n\u00e9ralement par un syndrome grippal avec une fi\u00e8vre forte, des courbatures, maux de t\u00eate ainsi qu\u2019une asth\u00e9nie&nbsp;<span class='whitespace-nowrap'><span id='easy-footnote-3-144508' class='easy-footnote-margin-adjust'><\/span><span class='easy-footnote'><a href='https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/#easy-footnote-bottom-3-144508' title='&lt;a href=&quot;https:\/\/www.bbc.com\/news\/health-45665821&quot; target=&quot;_blank&quot; rel=&quot;noreferrer noopener&quot;&gt;https:\/\/www.bbc.com\/news\/health-45665821&lt;\/a&gt;, BBC, 24 mai 2022.'><sup>3<\/sup><\/a><\/span><\/span>.<\/p>\n\n\n\n<p>Au bout de quelques jours appara\u00eet une \u00e9ruption cutan\u00e9o-muqueuse avec des v\u00e9sicules remplies de liquide qui vont se dess\u00e9cher, \u00e9voluer en cro\u00fbtes, puis cicatriser. Ces sympt\u00f4mes peuvent \u00e9voquer la varicelle, la rougeole, et surtout la variole, et une des particularit\u00e9s symptomatiques de la variole du singe est le gonflement des ganglions lymphatiques, notamment au niveau des oreilles, de la m\u00e2choire et de la nuque. Il est \u00e9galement \u00e0 noter que de nombreux cas r\u00e9cents pr\u00e9sentent des l\u00e9sions cutan\u00e9es au niveau de la r\u00e9gion g\u00e9nitale.<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-pullquote\"><blockquote><p>L\u2019incubation peut durer de 4 \u00e0 20 jours, la fi\u00e8vre dure en g\u00e9n\u00e9ral quelques jours, et la maladie gu\u00e9rit, le plus souvent spontan\u00e9ment, g\u00e9n\u00e9ralement en 2 \u00e0 4 semaines.<\/p><cite>Xavier Olessa-Daragon<\/cite><\/blockquote><\/figure>\n\n\n\n<p>L\u2019incubation peut durer de 4 \u00e0 20 jours, la fi\u00e8vre dure en g\u00e9n\u00e9ral quelques jours, et la maladie gu\u00e9rit, le plus souvent spontan\u00e9ment, g\u00e9n\u00e9ralement en 2 \u00e0 4 semaines. La contagiosit\u00e9 d\u00e9marre en g\u00e9n\u00e9ral avec les sympt\u00f4mes et s\u2019ach\u00e8ve avec la chute des cro\u00fbtes.&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>\u00c0 ce stade, on consid\u00e8re que l\u2019on peut classer l\u2019ensemble des souches virales de monkeypox responsables d\u2019\u00e9pid\u00e9mies de variole du singe en deux \u00ab&#160;clades&#160;\u00bb soit deux familles, le clade du \u00ab&#160;Bassin Congo&#160;\u00bb et le clade \u00ab&#160;Ouest Africain&#160;\u00bb. \u00c0 l\u2019instar du Sars-Cov-2, la maladie est particuli\u00e8rement sujette \u00e0 des formes graves et parfois mortelle au sein de certaines populations plus vuln\u00e9rables. Toutefois, ces populations incluent les enfants en plus des femmes enceintes et des personnes immunod\u00e9prim\u00e9es. Le taux de mortalit\u00e9 est \u00e9galement similaire au Sars-Cov-2 mais diff\u00e8re entre les clades. Le clade Bassin Congo aurait un taux de mortalit\u00e9 situ\u00e9 autour de 10&#160;%, contre 3&#160;% pour le clade Ouest Africain. De fa\u00e7on pour le moment assez rassurante, il semblerait que l\u2019\u00e9pid\u00e9mie actuelle en dehors d\u2019Afrique soit due \u00e0 une ou plusieurs souches d\u00e9riv\u00e9es du clade Ouest Africain, avec un taux de fatalit\u00e9 qui serait situ\u00e9 autour de quelques pour cent selon ce que l\u2019on sait actuellement.\u00a0<\/p>\n\n\n\n<p>Le mode de transmission du virus est un sujet complexe \u2014\u00a0source \u00e0 l\u2019heure actuelle de nombreuses incertitudes \u2013\u00a0et constitue l\u2019un des \u00e9l\u00e9ments de nouveaut\u00e9 de l\u2019\u00e9pid\u00e9mie actuelle de variole du singe. La transmission de l\u2019animal \u00e0 l\u2019homme peut se faire par morsure, griffure, par la pr\u00e9paration de viande, ou par contact avec des fluides corporels d\u2019animaux contamin\u00e9s. Il est \u00e0 noter que, jusqu\u2019\u00e0 pr\u00e9sent, il n\u2019y a pas de r\u00e9servoirs d\u2019animaux contamin\u00e9s en Europe, et qu\u2019ainsi la transmission de l\u2019homme \u00e0 l\u2019animal en Europe est \u00e0 surveiller de pr\u00e8s afin de pr\u00e9venir la constitution de tels r\u00e9servoirs. Les animaux r\u00e9servoirs \u00e9taient jusqu\u2019ici plut\u00f4t des rongeurs ou des singes, les deux plus fr\u00e9quents \u00e9tant le <em>Macaca fascicularis<\/em> ou \u00ab&#160;macaque mangeur de crabe&#160;\u00bb ainsi que le <em>Cynomys Ludovicianus<\/em> ou \u00ab&#160;chien de prairie&#160;\u00bb.\u00a0La contamination interhumaine quant \u00e0 elle se fait via le contact entre une source de contamination et une porte d\u2019entr\u00e9e chez le contamin\u00e9. La source peut \u00eatre une l\u00e9sion cutan\u00e9e ou une muqueuse de personne malade, comme un \u00e9l\u00e9ment contamin\u00e9 de l\u2019environnement du malade \u2013\u00a0surfaces, literie, v\u00eatements, vaisselle, linge de bain\u2026 Il subsiste de nombreuses incertitudes, mais il arrive fr\u00e9quemment que les virus \u00e0 ADN, de par la nature plus stable chimiquement de l\u2019ADN par rapport \u00e0 l\u2019ARN, soient plus r\u00e9sistants et subsistent plus longtemps dans l\u2019environnement. Au niveau du malade, la porte d\u2019entr\u00e9e peut se trouver au niveau d\u2019une l\u00e9sion de la peau, parfois tr\u00e8s petites, des voies respiratoires, ou des muqueuses. La transmission par a\u00e9rosol serait possible mais jusqu\u2019\u00e0 pr\u00e9sent limit\u00e9e\u2026 On peut \u00e0 ce titre rappeler qu\u2019on a pu voir dans le cas du Sars-Cov-2 et notamment de l\u2019\u00e9mergence de ses \u00ab&#160;variants&#160;\u00bb qu\u2019il s\u2019agit d\u2019un \u00e9l\u00e9ment potentiellement critique dont la nouveaut\u00e9 pourrait avoir des cons\u00e9quences tr\u00e8s importantes&nbsp;<span class='whitespace-nowrap'><span id='easy-footnote-4-144508' class='easy-footnote-margin-adjust'><\/span><span class='easy-footnote'><a href='https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/#easy-footnote-bottom-4-144508' title='\u201d&lt;a href=&quot;https:\/\/www.sante.fr\/monkeypox-information-pour-les-professionnels-de-sante&quot;&gt;Monkeypox&amp;#160;: information pour les professionnels de sant\u00e9&lt;\/a&gt;\u201d, &lt;em&gt;Sant\u00e9.fr&lt;\/em&gt;, 19 mai 2022'><sup>4<\/sup><\/a><\/span><\/span>.<\/p>\n\n\n\n<h2 class=\"wp-block-heading\">3 \u2014 <strong>La variole du singe est-elle une infection sexuellement transmissible (IST)&#160;?<\/strong><\/h2>\n\n\n\n<p>Il s\u2019agit d\u2019une question complexe, et certains \u00e9l\u00e9ments li\u00e9s \u00e0 l\u2019actuelle Epid\u00e9mie Exo Africaine de Variole du Singe (EEAVS) pourraient s\u2019ils n\u2019\u00e9taient pas pr\u00e9sent\u00e9s correctement, faire appara\u00eetre cette maladie en trompe l\u2019\u0153il et compliquer consid\u00e9rablement l\u2019endiguement de cette \u00e9pid\u00e9mie. L\u2019histoire montre que la mani\u00e8re dont sont initialement pr\u00e9sent\u00e9es les pathologies conditionne de fa\u00e7on profonde et durable la perception de celles-ci par les populations. En sant\u00e9 publique comme en politique, il est essentiel de donner le ton et d\u2019\u00e9crire les mots du cadre de r\u00e9cit qui seront employ\u00e9s ensuite. Un certain nombre de cas de l\u2019EEAVS seraient dus \u00e0 des contaminations via des rapports sexuels entre hommes. Cependant, il semblerait que la variole du singe ne soit pas une IST \u00e0 proprement parler dans le sens o\u00f9 il existerait de tr\u00e8s nombreux et divers autres modes de contamination. La transmission sexuelle de la variole du singe n\u2019est donc qu\u2019un mode de contamination comme un autre, tout comme un rapport avec quelqu\u2019un qui a la grippe ou la tuberculose \u00e0 de fortes chances de transmettre la grippe ou la tuberculose par les contacts rapproch\u00e9s, sans pour autant que ces maladies ne soient consid\u00e9r\u00e9es comme des IST. Anne Rimoin, professeur d\u2019\u00e9pid\u00e9miologie \u00e0 UCLA explique que cette transmission suite \u00e0 des rapports sexuels semble bien due au fait que ceux-ci constituent des \u00ab&#160;contacts rapproch\u00e9s&#160;\u00bb et \u00e0 ce stade pas au fait que le virus soit devenu sexuellement transmissible.&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>\u00c0 ce stade, la variole du singe ne saurait \u00eatre consid\u00e9r\u00e9e comme une IST, et ce n\u2019est certainement pas l\u2019affaire exclusive d\u2019une communaut\u00e9. Tout le monde y est potentiellement expos\u00e9.&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>Il y a ainsi un double enjeu majeur de communication&#160;: \u00e9viter que cette maladie ne soit pr\u00e9sent\u00e9e comme \u00ab&#160;une IST touchant les homosexuels et seulement eux&#160;\u00bb, et peut \u00eatre encore plus que tout \u00e9viter toute stigmatisation et utilisation de cette maladie comme pr\u00e9texte par certains r\u00e9gimes pour s\u2019adonner \u00e0 une r\u00e9pression homophobe pour \u00ab&#160;motif sanitaires&#160;\u00bb.<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-pullquote\"><blockquote><p>La transmission sexuelle de la variole du singe n\u2019est donc qu\u2019un mode de contamination comme un autre, tout comme un rapport avec quelqu\u2019un qui a la grippe ou la tuberculose \u00e0 de fortes chances de transmettre la grippe ou la tuberculose par les contacts rapproch\u00e9s, sans pour autant que ces maladies ne soient consid\u00e9r\u00e9es comme des IST.<\/p><\/blockquote><\/figure>\n\n\n\n<h2 class=\"wp-block-heading\">4 \u2014\u00a0<strong>Y a-t-il d\u00e9j\u00e0 eu des \u00e9pid\u00e9mies de variole du singe&#160;?<\/strong><\/h2>\n\n\n\n<p>Oui\u2026 et non.&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>Cette question nous ram\u00e8ne en r\u00e9alit\u00e9 aux d\u00e9bats de 2020 sur la diff\u00e9rence entre \u00e9pid\u00e9mie et pand\u00e9mie. La variole du singe n\u2019en est actuellement pas au stade pand\u00e9mique, loin \u2013 tr\u00e8s loin \u2013 de l\u00e0. Cependant, l\u2019\u00e9pid\u00e9mie actuelle pr\u00e9sente un caract\u00e8re in\u00e9dit par rapport aux \u00e9pid\u00e9mies pr\u00e9c\u00e9dentes.&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>Celles-ci ont touch\u00e9 dix pays africains et les \u00c9tats-Unis, avec \u00e0 chaque fois un caract\u00e8re relativement restreint g\u00e9ographiquement par rapport \u00e0 l\u2019\u00e9pid\u00e9mie actuelle. En 2003, une \u00e9pid\u00e9mie a touch\u00e9 les \u00c9tats Unis, faisant sortir pour la premi\u00e8re fois la variole du singe du continent africain. Soixante-et-onze cas, six \u00c9tats du Midwest touch\u00e9s mais aucun mort, aucune transmission de l\u2019\u00eatre humain \u00e0 l\u2019\u00eatre humain. Il a \u00e9t\u00e9 estim\u00e9 que la cause de cette \u00e9pid\u00e9mie \u00e9taient des rats gambiens import\u00e9s dans le Texas, puis mis en contact de chiens de prairie. Les 71 cas auraient \u00e9t\u00e9 en contact avec des chiens de prairie contamin\u00e9s.&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>En 2017, le Nig\u00e9ria rapporte ses premiers cas en 40 ans. Depuis plus de 500 cas ont \u00e9t\u00e9 suspect\u00e9s et 200 confirm\u00e9s.\u00a0<\/p>\n\n\n\n<h2 class=\"wp-block-heading\">5 \u2014\u00a0<strong>Quelle est la situation actuelle&#160;?<\/strong><\/h2>\n\n\n\n<p>D\u2019apr\u00e8s sant\u00e9 publique France en date du 14 Juin 2022&#160;:&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>\u00ab&#160;Des cas de variole du singe (Monkeypox en anglais) sans lien direct avec un voyage en Afrique du Centre ou de l\u2019Ouest ou des personnes de retour de voyage ont \u00e9t\u00e9 signal\u00e9s en Europe et dans le monde, des cas suspects sont en cours d\u2019\u00e9valuation dans de nombreux pays et la situation \u00e9volue donc tr\u00e8s rapidement. En France, les infections par ce virus font l\u2019objet d\u2019une surveillance p\u00e9renne par le dispositif de la d\u00e9claration obligatoire. Compte tenu des alertes en cours, la surveillance de ces infections est renforc\u00e9e par Sant\u00e9 publique France et des messages d\u2019informations et d\u2019alerte sont adress\u00e9s aux professionnels de sant\u00e9.<\/p>\n\n\n\n<p>Cas de variole du singe&#160;: point de situation en France&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>Au 14 juin 2022 \u00e0 14h, 125 cas confirm\u00e9s de variole du singe ont \u00e9t\u00e9 rapport\u00e9s en France&#160;: 91 en Ile-de-France, 11 en Occitanie, 9 en Auvergne-Rh\u00f4ne-Alpes, 3 en Normandie, 3 dans les Hauts-de-France, 1 en Centre-val de Loire, 3 en Paca, 1 en Bourgogne-Franche-Comt\u00e9 et 3 en Nouvelle-Aquitaine.&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>Sur 111 cas confirm\u00e9s au 13 juin 2022 14h00, 108 ont fait l\u2019objet d\u2019une investigation, un demeure injoignable et 2 sont en cours d\u2019investigation.&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>Tous les cas investigu\u00e9s sont des hommes, \u00e2g\u00e9s entre 20 et 63 ans (\u00e2ge m\u00e9dian&#160;: 35 ans).&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>Les dates de d\u00e9but des sympt\u00f4mes s\u2019\u00e9tendent ente le 7 mai 2022 et le 9 juin 2022. Les cas sont diagnostiqu\u00e9s en m\u00e9diane 7 jours (entre 0 \u00e0 17 jours) apr\u00e8s le d\u00e9but des sympt\u00f4mes&#160;; de ce fait, les donn\u00e9es de la derni\u00e8re semaine ne sont pas consolid\u00e9es.<\/p>\n\n\n\n<p>Parmi les cas investigu\u00e9s, 77&#160;% ont pr\u00e9sent\u00e9 une \u00e9ruption g\u00e9nito-anale, 76&#160;% une \u00e9ruption sur une autre partie du corps, 68&#160;% une fi\u00e8vre, 62&#160;% des ad\u00e9nopathies, 14&#160;% une odynophagie, et 5&#160;% une toux. Parmi les cas investigu\u00e9s, 7 sont immunod\u00e9prim\u00e9s&#160;; aucun n\u2019est d\u00e9c\u00e9d\u00e9.&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>\u00c0 ce jour, comme dans les autres pays d\u2019Europe, ces cas sont survenus majoritairement, mais pas exclusivement, chez des hommes ayant des relations sexuelles avec des hommes (HSH), sans lien direct avec des personnes de retour de zone end\u00e9mique.\u00a0 La majorit\u00e9 des cas rapporte des partenaires sexuels multiples.<\/p>\n\n\n\n<p>La plupart des cas investigu\u00e9s d\u00e9clarent ne pas pouvoir identifier la personne qui les aurait contamin\u00e9s.&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>Enfin, 9 des cas investigu\u00e9s sont des cas secondaires, non vaccin\u00e9s.<\/p>\n\n\n\n<p>Parmi les cas investigu\u00e9s, 41 ont voyag\u00e9, s\u00e9journ\u00e9 ou travaill\u00e9 \u00e0 l\u2019\u00e9tranger avant le d\u00e9but de leurs sympt\u00f4mes, dont certains dans plusieurs pays diff\u00e9rents&#160;: 19 voyages sont ainsi rapport\u00e9s en Espagne, 7 en Belgique, 5 en Allemagne, 1 au Portugal, 1 au Royaume-Uni, 1 au Pays-Bas, 1 au Danemark, 1 au Luxembourg, 1 en Inde, 2 en Suisse, 1 aux Etats-Unis, 2 au Mali et 1 en Colombie. Ces voyages ne constituent pas syst\u00e9matiquement l\u2019origine de la contamination, et la liste des pays cit\u00e9s peut \u00e9voluer au fur et \u00e0 mesure que les donn\u00e9es sont consolid\u00e9es.<\/p>\n\n\n\n<p>Compte tenu de ce qui a \u00e9t\u00e9 observ\u00e9 en Europe sur la maladie, une communication cibl\u00e9e a \u00e9t\u00e9 rapidement mise en \u0153uvre en direction des personnes HSH. Les messages rappellent les modes de transmission, les sympt\u00f4mes, la conduite \u00e0 tenir en cas de sympt\u00f4mes. Ils sont actuellement diffus\u00e9s en digital sur le site Sexosafe d\u00e9di\u00e9 aux HSH et via les r\u00e9seaux sociaux. En parall\u00e8le, sur le terrain, des affiches, des flyers et des fiches-conseils ont \u00e9t\u00e9 diffus\u00e9s gr\u00e2ce aux acteurs associatifs, aux ARS et aux \u00e9quipes de Sexosafe pr\u00e9sentes sur le terrain. Les actions de pr\u00e9vention s\u2019adapteront \u00e0 l\u2019\u00e9volution de la situation.<\/p>\n\n\n\n<p><em>En l\u2019absence habituelle<\/em> de variole du singe en Europe et de lien rapport\u00e9 par les cas identifi\u00e9s avec une zone \u00e0 risque, le contexte europ\u00e9en actuel constitue une alerte et sugg\u00e8re une contamination en Europe. C\u2019est pourquoi, en France, la surveillance p\u00e9renne de la variole du singe par le dispositif de la d\u00e9claration obligatoire est renforc\u00e9e et des messages d\u2019informations et d\u2019alerte sont adress\u00e9s aux professionnels de sant\u00e9. Les \u00e9changes se poursuivent par ailleurs avec les autres pays europ\u00e9ens, l\u2019OMS et l\u2019ECDC.&#160;\u00bb<\/p>\n\n\n\n<p>D\u2019apr\u00e8s le minist\u00e8re de la sant\u00e9 en date du 19 mai 2022&#160;:\u00a0\u00a0<\/p>\n\n\n\n<p>\u00ab&#160;Plusieurs cas d&rsquo;infections autochtones \u00e0 Monkeypox (MKP) ont r\u00e9cemment \u00e9t\u00e9 signal\u00e9s dans plusieurs pays d&rsquo;Europe, par le Royaume-Uni, le Portugal, l&rsquo;Espagne et la Su\u00e8de. Des cas suspects sont en cours d&rsquo;investigation dans de nombreux pays. Il s&rsquo;agit d&rsquo;un ph\u00e9nom\u00e8ne inhabituel. Un premier cas suspect a \u00e9t\u00e9 signal\u00e9 ce jour en Ile-de-France.<\/p>\n\n\n\n<p>Pour l&rsquo;ensemble des cas confirm\u00e9s, les analyses ont mis en \u00e9vidence un virus appartenant au clade \u00ab&#160;Afrique de l&rsquo;ouest&#160;\u00bb du virus MKP, sugg\u00e9rant un lien initial avec le Nig\u00e9ria, pays dans lequel le virus circule r\u00e9guli\u00e8rement depuis 2017. Hormis le cas signal\u00e9 au Royaume-Uni le 7 mai dernier import\u00e9 du Nig\u00e9ria, les nouveaux cas signal\u00e9s ne rapportent pas de voyage en Afrique ou de lien avec une personne au retour d&rsquo;Afrique. \u00c0 ce stade, les cas rapport\u00e9s sont majoritairement b\u00e9nins, et il n&rsquo;y a pas de d\u00e9c\u00e8s signal\u00e9.&#160;\u00bb<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-pullquote\"><blockquote><p>Il semble que le g\u00e9nome du virus responsable d\u2019un cas au Portugal (Outbreak 2022 Portugal PT0001) et celui responsable d\u2019un cas \u00e0 Toulouse (apparent\u00e9 \u00e0 MT903343) soient tr\u00e8s l\u00e9g\u00e8rement \u00e9loign\u00e9s.<\/p><cite>XAvier Olessa-Daragon<\/cite><\/blockquote><\/figure>\n\n\n\n<p>Le 20 mai, l\u2019\u00e9quipe de chercheurs portugais de Jo\u00e3o Paulo Gomes publie une premi\u00e8re version du g\u00e9nome du virus&nbsp;<span class='whitespace-nowrap'><span id='easy-footnote-5-144508' class='easy-footnote-margin-adjust'><\/span><span class='easy-footnote'><a href='https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/#easy-footnote-bottom-5-144508' title='J. Isidro, V. Borges, M.Pinto, R. Ferreira, D.Sobral, A.Nunes, J. Dourado santos, M. Jos\u00e9 Borego, S. Nuncio, A. Pelerito, R. Cordeiro, J. Paulo Gomez, \u201c&lt;a href=&quot;https:\/\/virological.org\/t\/first-draft-genome-sequence-of-monkeypox-virus-associated-with-the-suspected-multi-country-outbreak-may-2022-confirmed-case-in-portugal\/799&quot; target=&quot;_blank&quot; rel=&quot;noreferrer noopener&quot;&gt;First draft genome sequence of Monkeypox virus associated with the suspected multi-country outbreak, May 2022 (confirmed case in Portugal)&lt;\/a&gt;\u201d, &lt;em&gt;Monkeypox, &lt;\/em&gt;20 mai 2022'><sup>5<\/sup><\/a><\/span><\/span>, et le 26 mai l\u2019\u00e9quipe toulousaine de Guillaume Croville publie \u00e0 son tour un g\u00e9nome du monkeypox virus provenant d\u2019une patiente hospitalis\u00e9e au CHU de Purpan \u00e0 Toulouse. Une fois soulign\u00e9 le caract\u00e8re in\u00e9dit et presque miraculeux de l\u2019obtention aussi rapide de donn\u00e9es aussi riches, on peut en r\u00e9aliser une premi\u00e8re analyse tr\u00e8s sommaire et qu\u2019il faut ainsi prendre avec \u00e9norm\u00e9ment de pr\u00e9cautions. Elle offre essentiellement deux pistes&#160;:<\/p>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\"><li>Tout d\u2019abord les deux g\u00e9nomes appartiennent bien au clade \u00ab&#160;Afrique de l\u2019Ouest&#160;\u00bb, ce qui comme cela a \u00e9t\u00e9 \u00e9voqu\u00e9 \u00e0 potentiellement des implications importantes en termes de mortalit\u00e9. Ce clade a une mortalit\u00e9 plus faible \u2013 autour de quelques points de pourcentage \u2013 contre une mortalit\u00e9 plus importante autour de 10&#160;% pour le clade Bassin Congo\/Afrique Centrale.\u00a0<\/li><li>Il semble que le g\u00e9nome du virus responsable d\u2019un cas au Portugal (Outbreak 2022 Portugal PT0001) et celui responsable d\u2019un cas \u00e0 Toulouse (apparent\u00e9 \u00e0 MT903343) soient tr\u00e8s l\u00e9g\u00e8rement \u00e9loign\u00e9s. Cela repr\u00e9senterait environ une centaine de caract\u00e8res d\u2019ADN sur une s\u00e9quence d\u2019environ 196 923 caract\u00e8res, mais comme le graphique repr\u00e9sentant l\u2019arbre phylog\u00e9n\u00e9tique sommaire et provisoire des g\u00e9nomes des diff\u00e9rentes souches du virus le montre, cela est suffisant pour permettre de les distinguer. Les deux souches restent tr\u00e8s proches, et semblent apparent\u00e9es \u00e0 une souche export\u00e9e bri\u00e8vement du Nig\u00e9ria vers le Royaume Uni, Isra\u00ebl et Singapour en 2018 et 2019 ce qui irait dans le sens d\u2019une contamination initiale sur le continent europ\u00e9en au Royaume Uni, potentiellement via le Nig\u00e9ria.<\/li><\/ul>\n\n\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-image wp-block-image-medium\"\n    data-shadow=\"false\"\n    data-use-original-file=\"false\">\n    <a\n        data-pswp-src=\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-content\/uploads\/sites\/2\/2022\/06\/ca8ddb4a8488b294fddb44fbcabf3f40c6c93e7b.jpeg\"\n        class=\"inline-block gallery-item no-underline \"\n        data-pswp-width=\"1438\"\n        data-pswp-height=\"1104\">\n                                        <picture>\r\n                    <source\r\n                srcset=\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-content\/uploads\/sites\/2\/2022\/06\/ca8ddb4a8488b294fddb44fbcabf3f40c6c93e7b-330x253.jpeg\"\r\n                media=\"(max-width:  374px)\" \/>\r\n                    <source\r\n                srcset=\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-content\/uploads\/sites\/2\/2022\/06\/ca8ddb4a8488b294fddb44fbcabf3f40c6c93e7b-690x530.jpeg\"\r\n                media=\"(max-width:  989px)\" \/>\r\n                    <source\r\n                srcset=\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-content\/uploads\/sites\/2\/2022\/06\/ca8ddb4a8488b294fddb44fbcabf3f40c6c93e7b-990x760.jpeg\"\r\n                media=\"(max-width: 1319px)\" \/>\r\n                    <source\r\n                srcset=\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-content\/uploads\/sites\/2\/2022\/06\/ca8ddb4a8488b294fddb44fbcabf3f40c6c93e7b-690x530.jpeg\"\r\n                media=\"(max-width: 1599px)\" \/>\r\n                    <source\r\n                srcset=\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-content\/uploads\/sites\/2\/2022\/06\/ca8ddb4a8488b294fddb44fbcabf3f40c6c93e7b-990x760.jpeg\"\r\n                media=\"(min-width: 1600px)\" \/>\r\n                <img decoding=\"async\" src=\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-content\/uploads\/sites\/2\/2022\/06\/ca8ddb4a8488b294fddb44fbcabf3f40c6c93e7b-125x96.jpeg\" \/>\r\n        <\/picture>\r\n                            \n            <\/a>\n<\/figure>\n\n\n<p>Enfin d\u2019apr\u00e8s l\u2019OMS en date du 14 juin 2022&#160;:\u00a0<\/p>\n\n\n\n<p>\u00ab&#160;1600 cas ont \u00e9t\u00e9 confirm\u00e9s et 1500 sont suspect\u00e9s. Les cas concernent 39 pays, 7 ou le virus est d\u00e9tect\u00e9 depuis plusieurs ann\u00e9es et 32 ou sa pr\u00e9sence est nouvelle. Il y aurait 72 morts, tous dans les 7 pays ou le virus est d\u00e9tect\u00e9 depuis plusieurs ann\u00e9es, m\u00eame si l\u2019OMS porte une attention particuli\u00e8re \u00e0 certaines informations en provenance du Br\u00e9sil.&#160;\u00bb<\/p>\n\n\n\n<p>Hans Kluge, directeur de l\u2019OMS Europe estime que \u00ab&#160;L&rsquo;Europe reste l&rsquo;\u00e9picentre de cette vague en pleine expansion, 25 pays ayant signal\u00e9 plus de 1.500 cas, soit 85&#160;% du total mondial&#160;\u00bb. Mais aussi que \u201cL&rsquo;ampleur de cette \u00e9pid\u00e9mie pr\u00e9sente un risque r\u00e9el&#160;: plus le virus circulera longtemps, plus il \u00e9tendra sa port\u00e9e et plus la maladie s&rsquo;implantera dans les pays non end\u00e9miques&#160;\u00bb.&nbsp;<span class='whitespace-nowrap'><span id='easy-footnote-6-144508' class='easy-footnote-margin-adjust'><\/span><span class='easy-footnote'><a href='https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/#easy-footnote-bottom-6-144508' title='&lt;a href=&quot;https:\/\/www.rtl.be\/info\/monde\/international\/variole-du-singe-l-europe-est-au-coeur-de-la-propagation-de-la-maladie-selon-l-organisation-mondiale-de-la-sante-1383524.aspx&quot;&gt;https:\/\/www.rtl.be\/info\/monde\/international\/variole-du-singe-l-europe-est-au-coeur-de-la-propagation-de-la-maladie-selon-l-organisation-mondiale-de-la-sante-1383524.aspx&lt;\/a&gt;'><sup>6<\/sup><\/a><\/span><\/span><\/p>\n\n\n\n<p>Les experts de l\u2019OMS se r\u00e9uniront le 23 juin pour d\u00e9terminer si l\u2019\u00e9pid\u00e9mie actuelle de \u00ab&#160;variole du singe&#160;\u00bb constitue une \u00ab&#160;Urgence de Sant\u00e9 Publique d\u2019int\u00e9r\u00eat International&#160;\u00bb, le plus haut niveau d\u2019alerte de l\u2019OMS, actuellement uniquement activ\u00e9 pour la polio et le Covid-19&nbsp;<span class='whitespace-nowrap'><span id='easy-footnote-7-144508' class='easy-footnote-margin-adjust'><\/span><span class='easy-footnote'><a href='https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/#easy-footnote-bottom-7-144508' title='&lt;a href=&quot;https:\/\/news.un.org\/en\/story\/2022\/06\/1120392&quot; target=&quot;_blank&quot; rel=&quot;noreferrer noopener&quot;&gt;https:\/\/news.un.org\/en\/story\/2022\/06\/1120392&lt;\/a&gt;'><sup>7<\/sup><\/a><\/span><\/span>.<\/p>\n\n\n\n<h2 class=\"wp-block-heading\"><strong>6<\/strong> \u2014 <strong>Quels sont les \u00e9l\u00e9ments \u00ab&#160;nouveaux&#160;\u00bb de l\u2019\u00e9pid\u00e9mie actuelle suscitant un int\u00e9r\u00eat particulier&#160;?\u00a0<\/strong><\/h2>\n\n\n\n<p>En simplifiant beaucoup, on pourrait dire en premi\u00e8re approche que la communaut\u00e9 m\u00e9dicale et scientifique est en alerte car le nombre de cas de variole du singe d\u00e9tect\u00e9s hors d\u2019Afrique au cours de la deuxi\u00e8me quinzaine de mai 2022, et qui va probablement encore augmenter, est sup\u00e9rieure au nombre cumul\u00e9 de cas d\u00e9tect\u00e9s hors d\u2019Afrique avant cela depuis 1970.&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>En simplifiant l\u00e9g\u00e8rement moins, on peut consid\u00e9rer que les trois \u00e9l\u00e9ments \u00ab&#160;nouveaux&#160;\u00bb qui ont interpell\u00e9 les autorit\u00e9s sanitaires sont&#160;:&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\"><li>les lieux d\u2019apparition du virus&#160;: plusieurs centaines de cas hors d\u2019Afrique ce qui semble tr\u00e8s inhabituel. Dans la contamination am\u00e9ricaine de 2003 d\u00e9j\u00e0 mentionn\u00e9e, seuls 71 cas avaient \u00e9t\u00e9 identifi\u00e9s, limit\u00e9s \u00e0 six \u00c9tats am\u00e9ricains. On a retrouv\u00e9 des cas en 2018-2019 au Royaume-Uni, en Isra\u00ebl et \u00e0 Singapour mais il y avait beaucoup moins de cas et beaucoup moins de pays Ian Sample \u201c<a href=\"https:\/\/www.theguardian.com\/world\/2022\/may\/25\/monkeypox-may-have-been-circulating-in-uk-for-years-scientists-say\">Monkeypox may have been circulating in UK for years, scientists say<\/a> \u201c The Guardian, 25 mai 2022. On parle aujourd\u2019hui de 20 pays&#160;: 16 en Europe, 1 en Am\u00e9rique du Nord, 1 au Moyen Orient et 1 en dans l\u2019Oc\u00e9an Pacifique \u00e0 savoir l\u2019Australie. Bien plus de cas, dans bien plus de pays, bien plus \u00e9parpill\u00e9s g\u00e9ographiquement \u201c<a href=\"https:\/\/www.who.int\/emergencies\/disease-outbreak-news\/item\/2022-DON385\">Multi-country monkeypox outbreak in non-endemic countries<\/a>\u201d, <em>World health Organization<\/em>, 21 mai 2022 .&nbsp;<\/li><\/ul>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\"><li>le mode de transmission du virus&#160;: il semble en effet extr\u00eamement probable que nous ayons affaire \u00e0 une transmission interhumaine \u00ab&#160;non sporadique&#160;\u00bb. En effet, dans l\u2019\u00e9mergence de micro-organismes pathog\u00e8nes, et notamment de virus, l\u2019\u00e9tape critique est l\u2019\u00e9tablissement d\u2019une transmission interhumaine soutenue. De nombreux virus circulent d\u2019abord au sein d\u2019esp\u00e8ces animales, et passent parfois de fa\u00e7on assez rare chez l\u2019homme, mais c\u2019est un ph\u00e9nom\u00e8ne \u00ab&#160;exceptionnel&#160;\u00bb qui constitue un cul-de-sac. Ils ne peuvent ensuite pas se transmettre chez d\u2019autres h\u00f4tes humains. Parfois, ils acqui\u00e8rent des mutations qui leur permettront de se transmettre entre \u00eatres humains de fa\u00e7on efficace et continue. Et c\u2019est \u00e0 partir de l\u00e0 qu\u2019ils acqui\u00e8rent r\u00e9ellement le potentiel d\u2019engendrer des \u00e9pid\u00e9mies. Le VIH circulait d\u2019abord chez les singes, puis sporadiquement du singe \u00e0 l\u2019homme, et enfin entre \u00eatres humains. De m\u00eame pour de nombreuses souches du virus de la grippe circulant notamment chez le porc, le canard, le poulet et d\u2019autres volailles. La comparaison avec l\u2019\u00e9pid\u00e9mie de 2003 aux \u00c9tats-Unis est ici particuli\u00e8rement frappante&#160;: sur les 71 cas de l\u2019\u00e9poque, tous avaient pu \u00eatre reli\u00e9s \u00e0 un contact direct avec un chien de prairie qui pouvait expliquer ces contaminations. L\u2019\u00e9pid\u00e9mie de 2022 pr\u00e9sente un nombre croissant de cas sans aucun lien direct, ni avec un pays d\u2019Afrique, ni avec un animal contamin\u00e9. Or si l\u2019on avait d\u00e9j\u00e0 observ\u00e9 des transmissions interhumaines communautaires du <em>monkeypox virus<\/em>, cela n\u2019a jamais \u00e9t\u00e9 le cas hors d\u2019Afrique.&nbsp;<\/li><\/ul>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\"><li>le bruit produit par le virus. Il semblerait qu\u2019\u00e9merge un <em>pattern<\/em> de cas non seulement sans lien direct et r\u00e9cent avec l\u2019Afrique ou un animal contamin\u00e9, mais aussi et de fa\u00e7on plus pr\u00e9occupante, sans lien entre eux.\u00a0 Andrea Mc Collum, \u00e9pid\u00e9miologiste en charge de l\u2019\u00e9quipe \u00ab&#160;Poxvirus&#160;\u00bb du Center for Disease Control am\u00e9ricain, explique ainsi que l\u00e0 o\u00f9 il est relativement commun pour le Sars-Cov-2 de provoquer des infections asymptomatiques, la variole du singe provoquait jusqu\u2019ici presque toujours des sympt\u00f4mes, et notamment des l\u00e9sions de la peau. Elle explique ainsi que la perspective potentielle d\u2019infections asymptomatiques du <em>monkeypox virus<\/em> serait \u00ab&#160;particuli\u00e8rement pr\u00e9occupante&#160;\u00bb en raison des immenses complications que cela engendrerait dans le tra\u00e7age et l\u2019endiguement des cha\u00eenes de contaminations.\u00a0<\/li><\/ul>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-pullquote\"><blockquote><p>L\u2019\u00e9pid\u00e9mie de 2022 pr\u00e9sente un nombre croissant de cas sans aucun lien direct, ni avec un pays d\u2019Afrique, ni avec un animal contamin\u00e9. Or si l\u2019on avait d\u00e9j\u00e0 observ\u00e9 des transmissions interhumaines communautaires du <em>monkeypox virus<\/em>, cela n\u2019a jamais \u00e9t\u00e9 le cas hors d\u2019Afrique.\u00a0<\/p><cite>Xavier Olessa-Daragon<\/cite><\/blockquote><\/figure>\n\n\n\n<p>Cet int\u00e9r\u00eat particulier n\u2019est ainsi pas tant d\u00fb \u00e0 un danger imminent pos\u00e9 par le virus \u00e0 l\u2019encontre des syst\u00e8mes de sant\u00e9 qu\u2019\u00e0 une volont\u00e9 de renforcer pr\u00e9cocement les efforts d\u2019investigation, de tra\u00e7age des cas et de compr\u00e9hension de ce qui se passe. Le Dr Agam Rao, m\u00e9decin de la division Pr\u00e9vention des Pathog\u00e8nes \u00e0 Fort Impact du CDC am\u00e9ricain s\u2019en tient \u00e0 une pr\u00e9conisation g\u00e9n\u00e9rale&#160;:<\/p>\n\n\n\n<p>\u00ab&#160;Il s\u2019agit d\u2019expliquer que la variole du singe constitue un probl\u00e8me \u00e9mergent. Certains probl\u00e8mes \u00e9mergents s\u2019av\u00e8rent au final b\u00e9nins. D\u2019autres prennent de l\u2019ampleur et empirent. Nous demandons simplement aux gens de garder cette question en t\u00eate pour le moment.&#160;\u00bb&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>L\u2019enjeu, \u00e0 l\u2019instar des premiers temps de l\u2019\u00e9mergence du Sars-Cov-2 est triple&#160;:&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\"><li>casser les cha\u00eenes de contamination et \u00ab&#160;\u00e9teindre&#160;\u00bb l\u2019\u00e9pid\u00e9mie avant qu\u2019elle ne d\u00e9marre, l\u2019extinction pr\u00e9coce de la transmission \u00e9tant \u2013 il faut le rappeler \u2013 ce qui se produit dans la majorit\u00e9 des situations analogues. Les contaminations dans tous ces pays proviennent-elles d\u2019une m\u00eame origine unique&#160;? Ou a-t-on affaire \u00e0 plusieurs \u00e9pid\u00e9mies se d\u00e9clarant en m\u00eame temps&#160;? \u00c0 terme, l\u2019enjeu du tra\u00e7age permettra de r\u00e9pondre \u00e0 cette question cruciale.&nbsp;<\/li><\/ul>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\"><li>si ce ph\u00e9nom\u00e8ne prend de l\u2019ampleur et se poursuit, mobiliser de fa\u00e7on pr\u00e9coce l\u2019ensemble des ressources n\u00e9cessaires pour faire face \u00e0 une \u00e9pid\u00e9mie voire une pand\u00e9mie. Dans le cas de la variole du singe, ce second aspect est d\u2019autant plus critique que les outils th\u00e9rapeutiques et prophylactiques disponibles avec de tr\u00e8s bons espoirs d\u2019efficacit\u00e9 existent d\u00e9j\u00e0.<\/li><\/ul>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\"><li>comprendre ce qui se passe&#160;: pourquoi le virus se transmet-il soudainement \u00e0 la fois autant, aussi loin de sa zone de transmission, et probablement d\u2019\u00eatre humain \u00e0 \u00eatre humain. Le virus a-t-il mut\u00e9&#160;? Si oui, o\u00f9&#160;? et avec quelles cons\u00e9quences&#160;? De minuscules mutations \u2013&nbsp;quelques, voire parfois un seul caract\u00e8re sur la s\u00e9quence ADN de 196 913 caract\u00e8res du <em>monkeypox virus<\/em> \u2013 suffisent parfois \u00e0 avoir des cons\u00e9quences importantes sur les propri\u00e9t\u00e9s du virus, et m\u00eame si l\u2019on dispose d\u00e9j\u00e0 d\u2019au moins deux versions compl\u00e8tes de cette s\u00e9quence, il faudra probablement un peu de temps pour pouvoir l\u2019analyser en profondeur et mieux comprendre la nature du virus responsable de cette \u00e9pid\u00e9mie.<\/li><\/ul>\n\n\n\n<p>Ce qui suscite l\u2019int\u00e9r\u00eat de la communaut\u00e9 m\u00e9dicale et scientifique est la pr\u00e9sence d\u2019un \u00e9l\u00e9ment nouveau, et dans le m\u00eame temps l&rsquo;un des principaux enjeux est de comprendre en d\u00e9tail ce qu\u2019il a et n\u2019a pas de nouveau.<\/p>\n\n\n\n<h2 class=\"wp-block-heading\">7 \u2014 <strong>Peut-on envisager un impact sur la soci\u00e9t\u00e9 comparable \u00e0 celui de la pand\u00e9mie de Covid-19&#160;?\u00a0<\/strong><\/h2>\n\n\n\n<p>\u00c0 ce stade, cela semble peu probable. On peut, en simplifiant et admettant tout ce que l\u2019on ignore encore, appuyer cette affirmation sur trois grands axes.&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>Le premier concerne la transmissibilit\u00e9 du virus. Cet \u00e9l\u00e9ment est \u00e0 la fois le plus important et celui qui est le plus susceptible de changer s\u2019il s\u2019av\u00e8re que les souches responsables de cette \u00e9pid\u00e9mie ont des propri\u00e9t\u00e9s significativement diff\u00e9rentes des souches que l\u2019on connaissait qui les rendent plus transmissibles. Mais \u00e0 l\u2019heure actuelle, le virus ne semble pas avoir de capacit\u00e9 \u00e0 se transmettre entre \u00eatres humains assez forte pour \u00e9chapper \u00e0 de potentielles mesures de test, de tra\u00e7age et d\u2019isolation extensives.&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>Il faut notamment rappeler que ce qui a prolong\u00e9 la pand\u00e9mie de Covid-19 n\u2019est pas l\u2019incapacit\u00e9 \u00e0 g\u00e9rer la premi\u00e8re souche d\u00e9j\u00e0 tr\u00e8s transmissible, mais bien l\u2019\u00e9mergence de variants ultra transmissibles. \u00c0 ce stade en tout cas, les souches de <em>monkeypox virus<\/em> en circulation semblent tr\u00e8s loin de ces niveaux de transmissibilit\u00e9. Jay Hooper, virologiste au centre de recherche m\u00e9dicale sur les maladies infectieuses de l\u2019arm\u00e9e am\u00e9ricaine \u00e0 Fort Detrick explique que&#160;:<\/p>\n\n\n\n<p>\u00a0\u00ab&#160;Quand bien m\u00eame il semblerait y avoir une transmission interpersonnelle, elle ne semble \u00e0 ce stade pas se faire de fa\u00e7on aussi extensive qu\u2019avec le Sars-Cov-2. De plus, sa parent\u00e9 proche avec le virus de la variole laisse esp\u00e9rer que les nombreux traitements et vaccins disponibles seront relativement efficaces. Les scientifiques sont soucieux, car tout comportement viral nouveau suscite l\u2019int\u00e9r\u00eat, ils ne sont pas paniqu\u00e9s&nbsp;<span class='whitespace-nowrap'><span id='easy-footnote-8-144508' class='easy-footnote-margin-adjust'><\/span><span class='easy-footnote'><a href='https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/#easy-footnote-bottom-8-144508' title='Max Kozlov \u201c&lt;a href=&quot;https:\/\/www.nature.com\/articles\/d41586-022-01421-8&quot; target=&quot;_blank&quot; rel=&quot;noreferrer noopener&quot;&gt;Monkeypox goes global&amp;#160;: why scientists are on alert&lt;\/a&gt;\u201d, &lt;em&gt;Nature&lt;\/em&gt;, 20 mai 2022.'><sup>8<\/sup><\/a><\/span><\/span>.&#160;\u00bb<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-pullquote\"><blockquote><p>Ce qui suscite l\u2019int\u00e9r\u00eat de la communaut\u00e9 m\u00e9dicale et scientifique est la pr\u00e9sence d\u2019un \u00e9l\u00e9ment nouveau, et dans le m\u00eame temps l&rsquo;un des principaux enjeux est de comprendre en d\u00e9tail ce qu\u2019il a et n\u2019a pas de nouveau.<\/p><cite>Xavier Olessa-Daragon<\/cite><\/blockquote><\/figure>\n\n\n\n<p>Le second axe concerne justement l\u2019existence de vaccins et de traitements, d\u00e9velopp\u00e9s contre la variole mais qui semblent prometteurs \u00e9galement contre la variole du singe&nbsp;<span class='whitespace-nowrap'><span id='easy-footnote-9-144508' class='easy-footnote-margin-adjust'><\/span><span class='easy-footnote'><a href='https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/#easy-footnote-bottom-9-144508' title='\u201c&lt;a href=&quot;https:\/\/www.has-sante.fr\/jcms\/p_3340419\/fr\/monkeypox-vacciner-les-adultes-et-professionnels-de-sante-apres-une-exposition-a-la-maladie&quot; target=&quot;_blank&quot; rel=&quot;noreferrer noopener&quot;&gt;Monkeypox&amp;#160;: vacciner les adultes et professionnels de sant\u00e9 apr\u00e8s une exposition \u00e0 la maladie&lt;\/a&gt;\u201d, &lt;em&gt;Haute Autorit\u00e9 de Sant\u00e9,&lt;\/em&gt; 24 mai 2022.'><sup>9<\/sup><\/a><\/span><\/span>.<\/p>\n\n\n\n<p>&nbsp;Au d\u00e9but de la pand\u00e9mie de Covid on ne disposait de presque <a href=\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2020\/05\/26\/le-cas-raoult-10-points-sur-le-style-populiste-medical\/\">aucun traitement \u00e0 l\u2019efficacit\u00e9 <em>av\u00e9r\u00e9e<\/em><\/a>, et d\u2019aucun vaccin. Un d\u00e9ploiement pr\u00e9coce de ces moyens permettrait probablement, si le besoin se pr\u00e9sentait, d\u2019endiguer consid\u00e9rablement la mont\u00e9e en puissance du virus. Mais ces vaccins seront-ils d\u00e9ploy\u00e9s sans entrave&#160;? Les r\u00e9ticents \u00e0 la troisi\u00e8me dose accepteront-ils une premi\u00e8re dose de vaccin antivariolique&#160;?<\/p>\n\n\n\n<p>Il est toujours tr\u00e8s difficile d\u2019anticiper les comportements, mais le troisi\u00e8me axe devrait justement influencer la r\u00e9ponse des populations \u00e0 des mesures visant \u00e0 endiguer une \u00e9pid\u00e9mie de variole du singe&#160;: le virus touche les enfants et les femmes enceintes. Si une \u00e9pid\u00e9mie de variole du singe devait prendre de l\u2019ampleur, ceux qui jusqu\u2019ici craignaient plus le vaccin que le Covid, auraient-ils le sang froid de maintenir cette position face \u00e0 un risque de morts d\u2019enfants et de femmes enceintes&#160;? Les parents qui refusaient le vaccin \u00ab&#160;pour pr\u00e9server leurs enfants&#160;\u00bb ne finiront-ils pas, devant un nombre d\u2019enfants morts du virus en croissance et un nombre d\u2019enfants morts du vaccin stagnant autour de z\u00e9ro par changer d\u2019avis&#160;? Cela vaut \u00e9galement pour l\u2019ensemble des mesures. L\u2019id\u00e9e que le Covid-19 \u00ab&#160;ne touchait que les personnes \u00e2g\u00e9es&#160;\u00bb a pu nourrir un certain sentiment de ne pas \u00eatre concern\u00e9, de ne pas y \u00eatre vuln\u00e9rable au sein d\u2019une partie de la population qui s\u2019est ainsi montr\u00e9e de plus en plus hostile \u00e0 toute mesure de restriction visant \u00e0 prot\u00e9ger de quelque chose qu\u2019elle ne craignait pas. Un virus qui tue des enfants et des femmes enceintes entra\u00eenerait probablement un \u00e9lectrochoc bien plus puissant, et des sacrifices visant \u00e0 sauver des femmes enceintes et des enfants appara\u00eetraient probablement bien plus acceptables par la population que des sacrifices demand\u00e9s \u00e0 la jeunesse pour sauver des personnes plus \u00e2g\u00e9es.<\/p>\n\n\n\n<h2 class=\"wp-block-heading\"><strong>8<\/strong> \u2014\u00a0<strong>De quels moyens dispose-t-on \u00e0 l\u2019heure actuelle contre la variole du singe&#160;? \u00c0 quelle strat\u00e9gie s\u2019attendre de la part des pouvoirs publics&#160;? Qu\u2019est-ce que la <em>ring vaccination<\/em>&#160;?<\/strong><\/h2>\n\n\n\n<p>Une certaine bo\u00eete \u00e0 outils th\u00e9rapeutique et prophylactique d\u00e9velopp\u00e9e d\u2019abord contre la variole et ayant permis ni plus ni moins que son \u00e9radication, semble relativement prometteuse contre la variole du singe. On n\u2019a jamais pu la tester \u00e0 une ampleur suffisante, mais on dispose de donn\u00e9es pr\u00e9liminaires qui permettent un certain optimisme. Cette bo\u00eete \u00e0 outil s\u2019appuie surtout sur un vaccin (MVA-BN) et un m\u00e9dicament antiviral (Tecovirimat), autoris\u00e9s en Europe et stock\u00e9s par l\u2019arm\u00e9e am\u00e9ricaine pour lutter contre la variole et la variole du singe&nbsp;<span class='whitespace-nowrap'><span id='easy-footnote-10-144508' class='easy-footnote-margin-adjust'><\/span><span class='easy-footnote'><a href='https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/#easy-footnote-bottom-10-144508' title='&lt;a href=&quot;https:\/\/www.ema.europa.eu\/en\/medicines\/human\/EPAR\/tecovirimat-siga&quot; target=&quot;_blank&quot; rel=&quot;noreferrer noopener&quot;&gt;https:\/\/www.ema.europa.eu\/en\/medicines\/human\/EPAR\/tecovirimat-siga&lt;\/a&gt;, European Medicines Agency, Janvier 2022'><sup>10<\/sup><\/a><\/span><\/span>. Vaccin efficace \u00e0 85&#160;% contre la variole du singe selon la BBC, et ayant l\u2019avantage d\u2019\u00eatre \u00ab&#160;non r\u00e9plicatif&#160;\u00bb, ce qui signifie qu\u2019il peut \u00eatre administr\u00e9 \u00e0 un public large et notamment \u00e0 un certain nombre de personnes immunod\u00e9prim\u00e9es&nbsp;<span class='whitespace-nowrap'><span id='easy-footnote-11-144508' class='easy-footnote-margin-adjust'><\/span><span class='easy-footnote'><a href='https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/#easy-footnote-bottom-11-144508' title='\u00ab&amp;#160;&lt;a href=&quot;https:\/\/www.ecdc.europa.eu\/en\/publications-data\/risk-assessment-monkeypox-multi-country-outbreak&quot; target=&quot;_blank&quot; rel=&quot;noreferrer noopener&quot;&gt;Risk assessment&amp;#160;: Monkeypox multi-country outbreak&lt;\/a&gt;\u00ab&amp;#160;, European Center for Disease Prevention, 23 mai 2022.'><sup>11<\/sup><\/a><\/span><\/span>.<\/p>\n\n\n\n<p>La <em>ring vaccination<\/em> ou vaccination cibl\u00e9e, est un protocole visant \u00e0 cr\u00e9er \u00ab&#160;un anneau vaccinal autour d\u2019un cas&#160;\u00bb afin d\u2019emp\u00eacher la diffusion tout en pr\u00e9servant des moyens logistiques et sanitaires s\u00e9rieusement \u00e9prouv\u00e9s par des campagnes de vaccination de masse. Cette strat\u00e9gie, utilis\u00e9e avec succ\u00e8s dans l\u2019\u00e9radication de la variole au XX<sup>e<\/sup> si\u00e8cle ainsi que lors de l\u2019\u00e9pid\u00e9mie d\u2019\u00c9bola de 2018&nbsp;<span class='whitespace-nowrap'><span id='easy-footnote-12-144508' class='easy-footnote-margin-adjust'><\/span><span class='easy-footnote'><a href='https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/#easy-footnote-bottom-12-144508' title='&lt;a href=&quot;https:\/\/www.npr.org\/sections\/goatsandsoda\/2018\/05\/15\/611267872\/can-the-new-ebola-vaccine-stop-the-latest-outbreak?t=1653585347745&amp;amp;t=1653666141368&quot; target=&quot;_blank&quot; rel=&quot;noreferrer noopener&quot;&gt;https:\/\/www.npr.org\/sections\/goatsandsoda\/2018\/05\/15\/611267872\/can-the-new-ebola-vaccine-stop-the-latest-outbreak?t=1653585347745&amp;amp;t=1653666141368&lt;\/a&gt;&lt;em&gt;,npr&lt;\/em&gt;, 15 mai 2018'><sup>12<\/sup><\/a><\/span><\/span>, avec une certaine efficacit\u00e9 est notamment consid\u00e9r\u00e9e par le CDC am\u00e9ricain comme la \u00ab&#160;strat\u00e9gie de premi\u00e8re ligne contre la variole&#160;\u00bb&nbsp;<span class='whitespace-nowrap'><span id='easy-footnote-13-144508' class='easy-footnote-margin-adjust'><\/span><span class='easy-footnote'><a href='https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/#easy-footnote-bottom-13-144508' title='\u201d&lt;a href=&quot;https:\/\/www.cdc.gov\/smallpox\/bioterrorism-response-planning\/public-health\/ring-vaccination.html&quot;&gt;Ring Vaccination | Smallpox | CDC&lt;\/a&gt;\u201d, Center for Disease Control and Prevention, 2 d\u00e9cembre 2019&amp;#160;; Beth Mole \u201c&lt;a href=&quot;https:\/\/arstechnica.com\/science\/2019\/04\/ebola-vaccine-is-97-5-effective-early-outbreak-data-suggests\/&quot;&gt;As Ebola outbreak rages, vaccine is 97.5&amp;#160;% effective, protecting over 90K people | Ars Technica&lt;\/a&gt;\u201d, &lt;em&gt;Ars technica&lt;\/em&gt;, 16 avril 2019&amp;#160;; Beth Mole \u201c&lt;a href=&quot;https:\/\/arstechnica.com\/science\/2018\/05\/vaccination-method-that-wiped-out-smallpox-gets-unleashed-today-on-ebola\/&quot;&gt;Vaccination method that wiped out smallpox gets unleashed today on Ebola | Ars Technica&lt;\/a&gt;\u201d &lt;em&gt;Ars technica&lt;\/em&gt;, 21 mai 2018'><sup>13<\/sup><\/a><\/span><\/span>.<\/p>\n\n\n\n<p>Enfin, en 2022 une approche compl\u00e8te de la sant\u00e9 se fait en raisonnant \u00e0 l\u2019\u00e9chelle pertinente&#160;: celle de tout un \u00e9cosyst\u00e8me o\u00f9 cohabitent notamment humains et animaux. Il semble souvent assez instinctif de consid\u00e9rer que certains pathog\u00e8nes passent de l\u2019animal \u00e0 l\u2019homme, mais on oublie tr\u00e8s souvent l\u2019\u00e9tape inverse, pourtant cruciale&#160;: la contamination d\u2019animaux par l\u2019homme. Comme cela a \u00e9t\u00e9 dit, il n\u2019y avait jusqu\u2019\u00e0 l\u2019\u00e9pid\u00e9mie r\u00e9cente pas de r\u00e9servoir animal \u00e9tabli de variole du singe en Europe. L\u2019\u00e9pid\u00e9mie actuelle pr\u00e9sente ainsi le risque, en plus de faire des victimes animales, de cr\u00e9er un tel r\u00e9servoir susceptible par la suite de d\u00e9clencher de nouvelles \u00e9pid\u00e9mies. Bien conscientes d\u2019une approche de <a href=\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2020\/12\/12\/sante-planetaire\/\">sant\u00e9 globale (\u00ab&#160;One Health&#160;\u00bb)<\/a>, les autorit\u00e9s europ\u00e9ennes ont ainsi appel\u00e9 \u00e0 une implication des professionnels de sant\u00e9 v\u00e9t\u00e9rinaire dans le dispositif de pr\u00e9vention et de lutte contre la variole du singe.\u00a0<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-pullquote\"><blockquote><p>La <em>ring vaccination<\/em> ou vaccination cibl\u00e9e, est un protocole visant \u00e0 cr\u00e9er \u00ab&#160;un anneau vaccinal autour d\u2019un cas&#160;\u00bb afin d\u2019emp\u00eacher la diffusion tout en pr\u00e9servant des moyens logistiques et sanitaires s\u00e9rieusement \u00e9prouv\u00e9s par des campagnes de vaccination de masse.<\/p><cite>Xavier Olessa-Daragon<\/cite><\/blockquote><\/figure>\n\n\n\n<h2 class=\"wp-block-heading\"><strong>9.<\/strong>&nbsp; &nbsp; <strong>Quels sont les enjeux li\u00e9s \u00e0 la g\u00e9nomique sur le continent africain&#160;?&nbsp;<\/strong><\/h2>\n\n\n\n<p>Un grand nombre de maladies infectieuses \u00e0 l\u2019impact, potentiel ou r\u00e9el, consid\u00e9rable sur la sant\u00e9 humaine mondiale \u00e9manent et touchent encore fortement l\u2019Afrique (SIDA, Tuberculose, \u00c9bola, Malaria, Lassa\u2026). On a notamment pu voir lors de l\u2019\u00e9mergence du variant omicron, toute l\u2019importance de travaux de surveillance \u00e9pid\u00e9mio g\u00e9n\u00e9tique, c\u2019est-\u00e0-dire de s\u00e9quen\u00e7age r\u00e9gulier d\u2019\u00e9chantillons afin de surveiller \u00ab&#160;les souches en circulation&#160;\u00bb. Ce sont ces travaux cruciaux, effectu\u00e9s par des scientifiques sud-africains, qui ont permis de lancer l\u2019alerte de fa\u00e7on tr\u00e8s pr\u00e9coce et ont constitu\u00e9 une aide inestimable pour les syst\u00e8mes de sant\u00e9 du monde entier.&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>On voit l\u00e0 encore dans le cadre de la variole du singe toute l\u2019importance de s\u00e9quencer. De plus, le continent africain pr\u00e9sente une des diversit\u00e9s g\u00e9n\u00e9tiques les plus importantes au monde. Pourtant, les travaux de recherche fondamentale sur les g\u00e9nomes africains comme de \u00ab&#160;surveillance \u00e9pid\u00e9mio-g\u00e9n\u00e9tique&#160;\u00bb manquent au regard des enjeux, non pas simplement pour le continent africain mais pour la sant\u00e9 mondiale. Seulement 2&#160;% des g\u00e9nomes s\u00e9quenc\u00e9s jusqu\u2019ici sont des g\u00e9nomes africains. Un certain nombre d\u2019initiatives comme la Soci\u00e9t\u00e9 Africaine de G\u00e9n\u00e9tique humaine (AfSHG), le projet Humanity Heredity and Health in Africa (H3Africa) ou encore le 3 Million African Genomes (3MAG) tentent de pallier ces manques. On peut esp\u00e9rer que de telles initiatives se multiplient et se renforcent, tant les enjeux li\u00e9s \u00e0 l\u2019investigation g\u00e9nomique sur le continent africain ne cessent de rappeler leur importance pour la sant\u00e9 mondiale.<\/p>\n\n\n\n<h2 class=\"wp-block-heading\"><strong>10.<\/strong>&nbsp; <strong>\u00c0 quel point le virus de la variole du singe est-il mutag\u00e8ne&#160;?&nbsp;<\/strong><\/h2>\n\n\n\n<p>Comme on a pu le voir avec le Sars-Cov-2, c\u2019est un point essentiel, qui d\u00e9terminera beaucoup de choses.<br>On en sait encore peu, mais on peut n\u00e9anmoins dessiner \u00e0 ce stade deux perspectives assez rassurantes sur ce point. Tout d\u2019abord sans entrer dans les d\u00e9tails techniques, les virus \u00e0 ADN comme le <em>monkeypox virus<\/em> sont en g\u00e9n\u00e9ral bien moins mutag\u00e8nes que les virus \u00e0 ARN et donc bien plus stables g\u00e9n\u00e9tiquement. Ensuite, il semble \u00e0 ce stade que, bien que poss\u00e9dant potentiellement quelques mutations, les souches s\u00e9quenc\u00e9es au Portugal et en France et dont les s\u00e9quences ont \u00e9t\u00e9 publi\u00e9es le 19 et le 26 mai 2022 semblent tr\u00e8s proches de souches pr\u00e9c\u00e9demment rencontr\u00e9es en 2018-2019. \u00c0 ce stade, on ne semble donc pas avoir affaire \u00e0 un ou des nouveaux virus.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Comment expliquer que des cas de \u00ab&#160;&#160;variole du singe&#160;&#160;\u00bb \u00e9mergent \u00e0 des points en apparence \u00e9loign\u00e9s du globe, apparemment sans lien entre eux&#160;&#160;? Qu&rsquo;y a-t-il de nouveau dans l&rsquo;\u00e9pid\u00e9mie r\u00e9cente de ce virus pourtant d\u00e9j\u00e0 connu&#160;&#160;? <\/p>\n<p>Nous proposons une premi\u00e8re synth\u00e8se en dix points pour comprendre ce ph\u00e9nom\u00e8ne, sur lequel l&rsquo;OMS se prononcera le 23 juin.<\/p>\n","protected":false},"author":10,"featured_media":144509,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"templates\/post-studies.php","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"_trash_the_other_posts":false,"footnotes":""},"categories":[2210],"tags":[],"staff":[2209],"editorial_format":[],"serie":[],"audience":[],"geo":[2163],"class_list":["post-144508","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-sante-publique","staff-xavier-olessa-daragon","geo-monde"],"acf":{"open_in_webview":false,"accent":false},"yoast_head":"<!-- This site is optimized with the Yoast SEO plugin v26.1.1 - https:\/\/yoast.com\/wordpress\/plugins\/seo\/ -->\n<title>Une nouvelle \u00e9pid\u00e9mie ? 10 points sur la variole du singe | Le Grand Continent<\/title>\n<meta name=\"robots\" content=\"index, follow, max-snippet:-1, max-image-preview:large, max-video-preview:-1\" \/>\n<link rel=\"canonical\" href=\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/\" \/>\n<meta property=\"og:locale\" content=\"fr_FR\" \/>\n<meta property=\"og:type\" content=\"article\" \/>\n<meta property=\"og:title\" content=\"Une nouvelle \u00e9pid\u00e9mie ? 10 points sur la variole du singe | Le Grand Continent\" \/>\n<meta property=\"og:description\" content=\"Comment expliquer que des cas de \u00ab&#160;variole du singe&#160;\u00bb \u00e9mergent \u00e0 des points en apparence \u00e9loign\u00e9s du globe, apparemment sans lien entre eux&#160;? Qu&#039;y a-t-il de nouveau dans l&#039;\u00e9pid\u00e9mie r\u00e9cente de ce virus pourtant d\u00e9j\u00e0 connu&#160;?   Nous proposons une premi\u00e8re synth\u00e8se en dix points pour comprendre ce ph\u00e9nom\u00e8ne, sur lequel l&#039;OMS se prononcera le 23 juin.\" \/>\n<meta property=\"og:url\" content=\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/\" \/>\n<meta property=\"og:site_name\" content=\"Le Grand Continent\" \/>\n<meta property=\"article:published_time\" content=\"2022-06-16T13:42:47+00:00\" \/>\n<meta property=\"article:modified_time\" content=\"2022-06-16T13:42:57+00:00\" \/>\n<meta property=\"og:image\" content=\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-content\/uploads\/sites\/2\/2022\/06\/gc-monkeypox-scaled.jpg\" \/>\n\t<meta property=\"og:image:width\" content=\"2560\" \/>\n\t<meta property=\"og:image:height\" content=\"1440\" \/>\n\t<meta property=\"og:image:type\" content=\"image\/jpeg\" \/>\n<meta name=\"author\" content=\"Matheo Malik\" \/>\n<meta name=\"twitter:card\" content=\"summary_large_image\" \/>\n<meta name=\"twitter:image\" content=\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-content\/uploads\/sites\/2\/2022\/06\/gc-monkeypox-scaled.jpg\" \/>\n<meta name=\"twitter:label1\" content=\"\u00c9crit par\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data1\" content=\"Matheo Malik\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:label2\" content=\"Dur\u00e9e de lecture estim\u00e9e\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data2\" content=\"43 minutes\" \/>\n<script type=\"application\/ld+json\" class=\"yoast-schema-graph\">{\"@context\":\"https:\/\/schema.org\",\"@graph\":[{\"@type\":\"WebPage\",\"@id\":\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/\",\"url\":\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/\",\"name\":\"Une nouvelle \u00e9pid\u00e9mie ? 10 points sur la variole du singe | Le Grand Continent\",\"isPartOf\":{\"@id\":\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/#website\"},\"primaryImageOfPage\":{\"@id\":\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/#primaryimage\"},\"image\":{\"@id\":\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/#primaryimage\"},\"thumbnailUrl\":\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-content\/uploads\/sites\/2\/2022\/06\/SIPA_AP22687686_000001-scaled.jpg\",\"datePublished\":\"2022-06-16T13:42:47+00:00\",\"dateModified\":\"2022-06-16T13:42:57+00:00\",\"author\":{\"@id\":\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/#\/schema\/person\/a1c2123a1ef5abd663fcde8f63063d45\"},\"breadcrumb\":{\"@id\":\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/#breadcrumb\"},\"inLanguage\":\"fr-FR\",\"potentialAction\":[{\"@type\":\"ReadAction\",\"target\":[\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/\"]}]},{\"@type\":\"ImageObject\",\"inLanguage\":\"fr-FR\",\"@id\":\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/#primaryimage\",\"url\":\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-content\/uploads\/sites\/2\/2022\/06\/SIPA_AP22687686_000001-scaled.jpg\",\"contentUrl\":\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-content\/uploads\/sites\/2\/2022\/06\/SIPA_AP22687686_000001-scaled.jpg\",\"width\":2560,\"height\":1706,\"caption\":\"FILE - This 2003 electron microscope image made available by the Centers for Disease Control and Prevention shows mature, oval-shaped monkeypox virions, left, and spherical immature virions, right, obtained from a sample of human skin associated with the 2003 prairie dog outbreak. British health officials reported 73 more monkeypox cases on Monday, June 6, 2022, raising the total to more than 300 across the country. (Cynthia S. Goldsmith, Russell Regner\/CDC via AP, File)\/CAITH104\/22157510937229\/AP PROVIDES ACCESS TO THIS PUBLICLY DISTRIBUTED HANDOUT PHOTO PROVIDED BY THE CDC; MANDATORY CREDIT 2003 FILE PHOTO\/2206061620\"},{\"@type\":\"BreadcrumbList\",\"@id\":\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/#breadcrumb\",\"itemListElement\":[{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":1,\"name\":\"Accueil\",\"item\":\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/\"},{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":2,\"name\":\"Une nouvelle \u00e9pid\u00e9mie&#160;? 10 points sur la variole du singe\"}]},{\"@type\":\"WebSite\",\"@id\":\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/#website\",\"url\":\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/\",\"name\":\"Le Grand Continent\",\"description\":\"L&#039;\u00e9chelle pertinente\",\"potentialAction\":[{\"@type\":\"SearchAction\",\"target\":{\"@type\":\"EntryPoint\",\"urlTemplate\":\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/?s={search_term_string}\"},\"query-input\":{\"@type\":\"PropertyValueSpecification\",\"valueRequired\":true,\"valueName\":\"search_term_string\"}}],\"inLanguage\":\"fr-FR\"},{\"@type\":\"Person\",\"@id\":\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/#\/schema\/person\/a1c2123a1ef5abd663fcde8f63063d45\",\"name\":\"Matheo Malik\",\"image\":{\"@type\":\"ImageObject\",\"inLanguage\":\"fr-FR\",\"@id\":\"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/#\/schema\/person\/image\/\",\"url\":\"https:\/\/secure.gravatar.com\/avatar\/62cbadb9f7f0804282928747d8d2051d?s=96&d=mm&r=g\",\"contentUrl\":\"https:\/\/secure.gravatar.com\/avatar\/62cbadb9f7f0804282928747d8d2051d?s=96&d=mm&r=g\",\"caption\":\"Matheo Malik\"}}]}<\/script>\n<!-- \/ Yoast SEO plugin. -->","yoast_head_json":{"title":"Une nouvelle \u00e9pid\u00e9mie ? 10 points sur la variole du singe | Le Grand Continent","robots":{"index":"index","follow":"follow","max-snippet":"max-snippet:-1","max-image-preview":"max-image-preview:large","max-video-preview":"max-video-preview:-1"},"canonical":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/","og_locale":"fr_FR","og_type":"article","og_title":"Une nouvelle \u00e9pid\u00e9mie ? 10 points sur la variole du singe | Le Grand Continent","og_description":"Comment expliquer que des cas de \u00ab&#160;variole du singe&#160;\u00bb \u00e9mergent \u00e0 des points en apparence \u00e9loign\u00e9s du globe, apparemment sans lien entre eux&#160;? Qu'y a-t-il de nouveau dans l'\u00e9pid\u00e9mie r\u00e9cente de ce virus pourtant d\u00e9j\u00e0 connu&#160;?   Nous proposons une premi\u00e8re synth\u00e8se en dix points pour comprendre ce ph\u00e9nom\u00e8ne, sur lequel l'OMS se prononcera le 23 juin.","og_url":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/","og_site_name":"Le Grand Continent","article_published_time":"2022-06-16T13:42:47+00:00","article_modified_time":"2022-06-16T13:42:57+00:00","og_image":[{"width":2560,"height":1440,"url":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-content\/uploads\/sites\/2\/2022\/06\/gc-monkeypox-scaled.jpg","type":"image\/jpeg"}],"author":"Matheo Malik","twitter_card":"summary_large_image","twitter_image":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-content\/uploads\/sites\/2\/2022\/06\/gc-monkeypox-scaled.jpg","twitter_misc":{"\u00c9crit par":"Matheo Malik","Dur\u00e9e de lecture estim\u00e9e":"43 minutes"},"schema":{"@context":"https:\/\/schema.org","@graph":[{"@type":"WebPage","@id":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/","url":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/","name":"Une nouvelle \u00e9pid\u00e9mie ? 10 points sur la variole du singe | Le Grand Continent","isPartOf":{"@id":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/#website"},"primaryImageOfPage":{"@id":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/#primaryimage"},"image":{"@id":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/#primaryimage"},"thumbnailUrl":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-content\/uploads\/sites\/2\/2022\/06\/SIPA_AP22687686_000001-scaled.jpg","datePublished":"2022-06-16T13:42:47+00:00","dateModified":"2022-06-16T13:42:57+00:00","author":{"@id":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/#\/schema\/person\/a1c2123a1ef5abd663fcde8f63063d45"},"breadcrumb":{"@id":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/#breadcrumb"},"inLanguage":"fr-FR","potentialAction":[{"@type":"ReadAction","target":["https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/"]}]},{"@type":"ImageObject","inLanguage":"fr-FR","@id":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/#primaryimage","url":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-content\/uploads\/sites\/2\/2022\/06\/SIPA_AP22687686_000001-scaled.jpg","contentUrl":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-content\/uploads\/sites\/2\/2022\/06\/SIPA_AP22687686_000001-scaled.jpg","width":2560,"height":1706,"caption":"FILE - This 2003 electron microscope image made available by the Centers for Disease Control and Prevention shows mature, oval-shaped monkeypox virions, left, and spherical immature virions, right, obtained from a sample of human skin associated with the 2003 prairie dog outbreak. British health officials reported 73 more monkeypox cases on Monday, June 6, 2022, raising the total to more than 300 across the country. (Cynthia S. Goldsmith, Russell Regner\/CDC via AP, File)\/CAITH104\/22157510937229\/AP PROVIDES ACCESS TO THIS PUBLICLY DISTRIBUTED HANDOUT PHOTO PROVIDED BY THE CDC; MANDATORY CREDIT 2003 FILE PHOTO\/2206061620"},{"@type":"BreadcrumbList","@id":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/2022\/06\/16\/une-nouvelle-epidemie-10-points-sur-la-variole-du-singe\/#breadcrumb","itemListElement":[{"@type":"ListItem","position":1,"name":"Accueil","item":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/"},{"@type":"ListItem","position":2,"name":"Une nouvelle \u00e9pid\u00e9mie&#160;? 10 points sur la variole du singe"}]},{"@type":"WebSite","@id":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/#website","url":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/","name":"Le Grand Continent","description":"L&#039;\u00e9chelle pertinente","potentialAction":[{"@type":"SearchAction","target":{"@type":"EntryPoint","urlTemplate":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/?s={search_term_string}"},"query-input":{"@type":"PropertyValueSpecification","valueRequired":true,"valueName":"search_term_string"}}],"inLanguage":"fr-FR"},{"@type":"Person","@id":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/#\/schema\/person\/a1c2123a1ef5abd663fcde8f63063d45","name":"Matheo Malik","image":{"@type":"ImageObject","inLanguage":"fr-FR","@id":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/#\/schema\/person\/image\/","url":"https:\/\/secure.gravatar.com\/avatar\/62cbadb9f7f0804282928747d8d2051d?s=96&d=mm&r=g","contentUrl":"https:\/\/secure.gravatar.com\/avatar\/62cbadb9f7f0804282928747d8d2051d?s=96&d=mm&r=g","caption":"Matheo Malik"}}]}},"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/144508","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/users\/10"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=144508"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/144508\/revisions"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media\/144509"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=144508"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=144508"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=144508"},{"taxonomy":"staff","embeddable":true,"href":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/staff?post=144508"},{"taxonomy":"editorial_format","embeddable":true,"href":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/editorial_format?post=144508"},{"taxonomy":"serie","embeddable":true,"href":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/serie?post=144508"},{"taxonomy":"audience","embeddable":true,"href":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/audience?post=144508"},{"taxonomy":"geo","embeddable":true,"href":"https:\/\/legrandcontinent.eu\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/geo?post=144508"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}